65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2676 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  37.28 
 
 
238 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  46.99 
 
 
237 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  36.84 
 
 
238 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  37.39 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  35.98 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  31.03 
 
 
241 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  30.86 
 
 
256 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  30.6 
 
 
246 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  30.08 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  30.17 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  39.42 
 
 
116 aa  95.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  29.83 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  29.67 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  29.67 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  26.84 
 
 
259 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  26.78 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  28.88 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  33.52 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  26.92 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  26.94 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  26.23 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  28.09 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  23.61 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  25.52 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  23.65 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  26.91 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  24.79 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  25.33 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  24.38 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  25.52 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  22.55 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  24.9 
 
 
244 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  25.53 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  21.7 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  25.74 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  25.21 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3084  hypothetical protein  37.62 
 
 
153 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  21.4 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  24.15 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  23.5 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0387  protein of unknown function DUF164  27.33 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0154383  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  22.69 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  24.17 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  23.36 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43037  predicted protein  27.89 
 
 
1122 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000542513  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  21.58 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  21.58 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  23.6 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  25.4 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  23.55 
 
 
245 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  24.27 
 
 
262 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00803  Fibronectin type III domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G14620)  26.14 
 
 
1066 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.154563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  22.22 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  24.38 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 
1143 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  24.08 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  27.61 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  20.38 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  23.08 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  23.27 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  23.9 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  31.58 
 
 
323 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  31.71 
 
 
239 aa  42  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>