14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3084 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3084  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  295  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  71.11 
 
 		 237 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  57.85 
 
 		 238 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  50.38 
 
 		 238 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  49.62 
 
 		 238 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  41.18 
 
 		 241 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  40.62 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  37.61 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  38.64 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  37.88 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  37.88 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  37.19 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  33.65 
 
 		 248 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2141  ISGsu1, transposase, interruption  100 
 
 		 362 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>