77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3301 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  54.51 
 
 
241 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  49.79 
 
 
238 aa  225  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  49.79 
 
 
238 aa  224  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  48.93 
 
 
238 aa  222  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  48.93 
 
 
237 aa  204  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  35.98 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  42.48 
 
 
116 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  31.38 
 
 
259 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  29.13 
 
 
246 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  32.02 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  31.74 
 
 
247 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  31.74 
 
 
247 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  31.74 
 
 
262 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  24.58 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  30.83 
 
 
237 aa  85.5  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  28.22 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  25.97 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  25.97 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  23.48 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  22.17 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  25.41 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  26.12 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  28.75 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  26.38 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  29.19 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  28.15 
 
 
247 aa  72  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  28.45 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  25.41 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  21.05 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  24.18 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  26.83 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  26.05 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  23.91 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  23.21 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  23.21 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3084  hypothetical protein  51.52 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.4 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  22.78 
 
 
238 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  26.02 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  23.81 
 
 
237 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  25.42 
 
 
246 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  23.29 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  21.83 
 
 
275 aa  62  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  26.56 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  24.47 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25.42 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  23.48 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  28.4 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  23.75 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  25 
 
 
239 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  24.69 
 
 
245 aa  55.1  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  25.1 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  25.1 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  25.37 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  23.64 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  25.52 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  30.36 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  29.41 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  24.69 
 
 
259 aa  48.9  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  29.91 
 
 
249 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  23.88 
 
 
239 aa  48.9  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  23.48 
 
 
268 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  28.76 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  24.02 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  25.78 
 
 
231 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  22.13 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  22.57 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.47 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  23.88 
 
 
265 aa  45.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  23.08 
 
 
261 aa  45.8  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  32.14 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  28.99 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  25.38 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  24.28 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  29.63 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>