50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07836 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  513  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  69.53 
 
 
259 aa  346  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  65.9 
 
 
261 aa  338  4e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  52.05 
 
 
250 aa  240  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  52.89 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  54.27 
 
 
248 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  50.42 
 
 
251 aa  224  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  50.42 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  47.46 
 
 
251 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  45.64 
 
 
262 aa  193  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  41.56 
 
 
254 aa  169  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  27.86 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  29.32 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  28.03 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  25.6 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  27.24 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  25.96 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  27.17 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  25.11 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  27.55 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  26.69 
 
 
238 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  24.68 
 
 
238 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  29.91 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  24.14 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  25.98 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  25.57 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  25.57 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  23.75 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  25.57 
 
 
238 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  24.55 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  25.45 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  25.47 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  22.36 
 
 
259 aa  55.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  24.03 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  25.55 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  23.79 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  24.36 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  23.86 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  23.79 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  27.5 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  24.15 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  20.85 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  22.03 
 
 
254 aa  46.2  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  21.93 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  24.27 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  22.5 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  24.7 
 
 
1621 aa  43.5  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  21.58 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  23.32 
 
 
240 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  23.83 
 
 
275 aa  42.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>