60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2044 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  496  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  52.97 
 
 
247 aa  248  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  47.3 
 
 
250 aa  228  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  50.42 
 
 
259 aa  226  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  50.42 
 
 
261 aa  224  9e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  49.58 
 
 
261 aa  219  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  47.9 
 
 
251 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  47.06 
 
 
248 aa  204  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  45.61 
 
 
248 aa  203  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  40.68 
 
 
254 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  40.51 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  28.46 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  27.06 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  28.24 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  25.98 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  25.1 
 
 
268 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  26.77 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  28.68 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  27.63 
 
 
266 aa  75.1  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  27.11 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  21.4 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  27.75 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  31.25 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  41.41 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  30.7 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  27.19 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  30.07 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  25.93 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  29.88 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  28.81 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  28.81 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  27.48 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  29.09 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  26.32 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  26.83 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  25.73 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  27.27 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  24.69 
 
 
249 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  28.1 
 
 
238 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  26.86 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  26.72 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  25.21 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  25.1 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  23.69 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  26.82 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  24.31 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  24.31 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  25.96 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  24.06 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  28.77 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  31.18 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.78 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  23.48 
 
 
241 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  22.32 
 
 
245 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  24.64 
 
 
237 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  30.48 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  25.64 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  23.81 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  25.11 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  22.37 
 
 
242 aa  42.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>