55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1840 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 262 aa  507  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  44.44 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  45.64 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  44.8 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  43.33 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  43.22 
 
 		 251 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  43.85 
 
 		 247 aa  185  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  44.17 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  38.43 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  40.51 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  33.76 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  33.46 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  30.8 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  28.84 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  30.34 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  28.9 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  25.96 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  29.41 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  30.94 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  27 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  27.53 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  25.32 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  29.11 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  25.32 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  28.45 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  25.74 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  23.5 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  23.68 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  31.65 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  25.81 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  28.02 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  33.13 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  27.05 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  22.81 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  25 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  25.89 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  23.35 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  27.16 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  25.32 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.08 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  30.91 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  22.03 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  24.27 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  22.47 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  29.51 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  22.47 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  23.5 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  29.31 
 
 		 116 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  30.3 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  30.3 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  22.22 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  25.3 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  25.86 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  23.6 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>