70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1806 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  488  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  65.56 
 
 
251 aa  308  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  64.75 
 
 
248 aa  305  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  54.88 
 
 
247 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  50.85 
 
 
250 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  54.27 
 
 
261 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  50.83 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  48.12 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  47.5 
 
 
261 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  45.61 
 
 
251 aa  203  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  44.44 
 
 
262 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  33.59 
 
 
266 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  31.54 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  31.58 
 
 
266 aa  91.7  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  30.42 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  29.62 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  32.06 
 
 
266 aa  85.9  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  28.51 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  27.75 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  26.34 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  25.43 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  28.79 
 
 
269 aa  78.6  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  26.56 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.23 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  26.38 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  23.65 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  25.1 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  24.12 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  26.23 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  25.99 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  22.22 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  24.08 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  27.39 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  22.95 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  22.88 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  22.03 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  24.26 
 
 
254 aa  62  0.000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  24.3 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  24.79 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  21.1 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  26.96 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  26.12 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  25.51 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  25.68 
 
 
239 aa  59.3  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  24.53 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  22.5 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  22.5 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  23.98 
 
 
253 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  24.4 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  26.05 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  31.42 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  22.08 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  29.41 
 
 
116 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  25.42 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  29.21 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  22.86 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  29.21 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  29.21 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  23.98 
 
 
238 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  23.98 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  22.22 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  22.36 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25.1 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.36 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 
1159 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  27.78 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  23.57 
 
 
958 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  24.54 
 
 
252 aa  42  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0603  hypothetical protein  26.6 
 
 
415 aa  42  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.614789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>