64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2084 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
245 aa  471  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  63.52 
 
 
249 aa  271  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  61.48 
 
 
244 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  53.94 
 
 
242 aa  232  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  50.41 
 
 
246 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  46.09 
 
 
246 aa  185  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  44.26 
 
 
253 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  44.67 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  45.11 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  43.62 
 
 
246 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  48.57 
 
 
247 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  40.74 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  40.74 
 
 
255 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  41.63 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  42.68 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  45.34 
 
 
234 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  41.42 
 
 
246 aa  141  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  41.15 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  39.75 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  37.96 
 
 
245 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  36.48 
 
 
247 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  36.03 
 
 
245 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  38.78 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  42.8 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  40.08 
 
 
242 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  38.11 
 
 
246 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  36.67 
 
 
245 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  36.18 
 
 
245 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  35.98 
 
 
245 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  34.19 
 
 
245 aa  89  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  32.64 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  32.64 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  32.64 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  26.69 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  27.75 
 
 
241 aa  62.8  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  26.45 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  42.68 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  20.09 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  28.69 
 
 
259 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  24.69 
 
 
237 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  22.22 
 
 
254 aa  52  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  29.45 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  28.08 
 
 
238 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  38.84 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  24.79 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  31.19 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  22.08 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  21.49 
 
 
235 aa  47  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  23.86 
 
 
239 aa  47  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  22.92 
 
 
238 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  22.41 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  32.65 
 
 
116 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  20.92 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  28.86 
 
 
239 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  31.25 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  22.67 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  21.77 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  26.46 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  22.18 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  25.83 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  31.08 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  25.41 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  22.58 
 
 
237 aa  42  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>