47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3619 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  79.51 
 
 
245 aa  360  8e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  61.22 
 
 
245 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  61.22 
 
 
245 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  61.22 
 
 
245 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  60.74 
 
 
245 aa  247  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  47.54 
 
 
245 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  45.83 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  46.31 
 
 
245 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  46.46 
 
 
245 aa  188  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  40.66 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  39.76 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  41.5 
 
 
246 aa  138  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  39.75 
 
 
246 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  39.92 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  43.5 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  40.25 
 
 
242 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  40.32 
 
 
253 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  35.98 
 
 
242 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  36.84 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  39.41 
 
 
237 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  40.82 
 
 
247 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  37.65 
 
 
245 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  37.8 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  34.03 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  35.32 
 
 
247 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  31.93 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  36.67 
 
 
245 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  39.51 
 
 
234 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  35.89 
 
 
244 aa  99  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  38.96 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  35.25 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  34.98 
 
 
246 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  26.2 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  25.1 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  35.44 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  26.25 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  25.7 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  23.67 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  31.65 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  24.29 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  29.69 
 
 
245 aa  45.4  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  22.29 
 
 
786 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  29.55 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  22.73 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  20.63 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  23.58 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>