67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2946 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
786 aa  1599    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0541  methyltransferase FkbM family  54 
 
 
739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0602  FkbM family methyltransferase  33.19 
 
 
700 aa  243  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.621895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  33.33 
 
 
985 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2732  methyltransferase FkbM family  31.98 
 
 
361 aa  87.8  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  31.72 
 
 
1209 aa  81.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 
1991 aa  74.7  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  32.32 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  24.36 
 
 
1232 aa  67.8  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  30.46 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.79 
 
 
1211 aa  66.6  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  26.21 
 
 
678 aa  65.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  24.29 
 
 
1092 aa  63.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2095  methyltransferase FkbM  30.82 
 
 
242 aa  62.4  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4199  methyltransferase FkbM family  26.49 
 
 
271 aa  60.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  23.98 
 
 
958 aa  60.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88532  predicted protein  27.64 
 
 
3608 aa  60.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.478087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  29.33 
 
 
245 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1399  methyltransferase FkbM family protein  27.05 
 
 
294 aa  56.6  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  25 
 
 
271 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  27.51 
 
 
266 aa  56.6  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2169  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
485 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0869424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  15.34 
 
 
209 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  19.06 
 
 
1177 aa  52.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0932  methyltransferase FkbM family  27.6 
 
 
319 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  21.5 
 
 
212 aa  51.2  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2452  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.62 
 
 
204 aa  51.2  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.633418  normal  0.137413 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  23.9 
 
 
926 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  19.01 
 
 
1192 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  26.44 
 
 
235 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  27.6 
 
 
356 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  23.05 
 
 
1170 aa  48.9  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  19.13 
 
 
257 aa  49.3  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13773  predicted protein  24.73 
 
 
1361 aa  48.9  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.102201  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0382  hypothetical protein  24.16 
 
 
519 aa  48.9  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000753973  hitchhiker  0.0000000239373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  25.41 
 
 
287 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4064  FkbM family methyltransferase  25.73 
 
 
237 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345765  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  25.41 
 
 
257 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1351  chromosome segregation ATPase-like protein  23.81 
 
 
726 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.100674 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  20.41 
 
 
1170 aa  47.8  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  21.95 
 
 
804 aa  47.8  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  27.2 
 
 
1186 aa  47.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  26.59 
 
 
1217 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  27.96 
 
 
1120 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.44 
 
 
797 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  27.96 
 
 
1120 aa  46.6  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3954  Chromosome segregation ATPase-like protein  23.74 
 
 
601 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  20.14 
 
 
1621 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  27.96 
 
 
1118 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 
1120 aa  46.6  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  22.3 
 
 
1189 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33608  predicted protein  20.36 
 
 
656 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145963  normal  0.0588293 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  27.96 
 
 
1120 aa  46.6  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  27.96 
 
 
1120 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  27.96 
 
 
1120 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  27.96 
 
 
1120 aa  46.6  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  27.96 
 
 
1120 aa  46.2  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1157  FkbM family methyltransferase  22.68 
 
 
253 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  18.84 
 
 
1175 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.42 
 
 
935 aa  45.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  29.17 
 
 
1384 aa  45.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0660  response regulator receiver  25.64 
 
 
620 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.528858  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  24.79 
 
 
1361 aa  45.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19480  hypothetical protein  31.31 
 
 
369 aa  44.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180142  normal  0.0118162 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31113  predicted protein  28.35 
 
 
1345 aa  44.3  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  30.92 
 
 
287 aa  44.3  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1286  hypothetical protein  22.99 
 
 
385 aa  44.3  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>