67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3461 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 246 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  49.19 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  48.37 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  51.42 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  49.59 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  47.15 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  49.6 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  46.56 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  48.18 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  44.44 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  44.31 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  44.31 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  47.3 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  46.19 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  43.72 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  42.51 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  45.71 
 
 		 247 aa  154  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  42.17 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  45.34 
 
 		 247 aa  151  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  40.89 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  41.84 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  45.73 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  43.93 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  39.75 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  39.34 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  39.36 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  43.72 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  35.83 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  35.83 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  35.83 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  35.54 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  36.59 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  23.78 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  27.02 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  26.25 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  27.05 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  26.34 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  32.26 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  43.66 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  33.87 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  27.03 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  27.03 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  27.03 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  25.56 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  22.22 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  22.45 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  23.16 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  32.05 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  22.99 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  21.79 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  31.82 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  28.47 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  25.33 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  23.23 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  23.76 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  23.53 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  25.65 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  32.87 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  32.88 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  22.66 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  37.68 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  27.11 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  19.64 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1279  hypothetical protein  39.13 
 
 		 122 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  22.97 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>