20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0387 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0387  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
237 aa  457  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0154383  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  28.57 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  23.31 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  26.23 
 
 
238 aa  55.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  26.64 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  24.58 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  27.33 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  25.41 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  24.07 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  22.55 
 
 
245 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  24.83 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  24.9 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  24.58 
 
 
238 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  39.13 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  23.11 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  28.12 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  28.21 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  23.69 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  29.67 
 
 
116 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>