55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0789 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  100 
 
 		 848 aa  1669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  57.18 
 
 		 857 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  57.18 
 
 		 857 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  53.94 
 
 		 904 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  53.88 
 
 		 855 aa  708    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  52.12 
 
 		 856 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  64.19 
 
 		 871 aa  781    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  52.84 
 
 		 858 aa  720    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  60.72 
 
 		 874 aa  795    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  52.96 
 
 		 915 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  53.44 
 
 		 857 aa  731    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  53.89 
 
 		 907 aa  718    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  52.85 
 
 		 856 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  71.31 
 
 		 367 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  71.31 
 
 		 367 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  50 
 
 		 787 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  50.31 
 
 		 799 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  50.31 
 
 		 799 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  47.9 
 
 		 846 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  44.34 
 
 		 941 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  44.8 
 
 		 835 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  49.66 
 
 		 842 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  47.84 
 
 		 769 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  48.64 
 
 		 639 aa  353  8.999999999999999e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  43.12 
 
 		 762 aa  339  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  42.15 
 
 		 790 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  39.18 
 
 		 719 aa  272  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  38.25 
 
 		 740 aa  261  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  36.08 
 
 		 741 aa  202  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  35.56 
 
 		 680 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0895  hypothetical protein  44.3 
 
 		 464 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  32.14 
 
 		 704 aa  165  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2521  translation initiation factor 2  39.02 
 
 		 372 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  26.08 
 
 		 784 aa  99.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  25.68 
 
 		 459 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  24.31 
 
 		 848 aa  84.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  33.71 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  51.95 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  46.39 
 
 		 472 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  44.74 
 
 		 488 aa  73.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  33.17 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  34.71 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  37.98 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  37.98 
 
 		 485 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  42 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  37.9 
 
 		 487 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  28.73 
 
 		 209 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  25 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  26.26 
 
 		 489 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  24.14 
 
 		 484 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  30.21 
 
 		 268 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  18.98 
 
 		 3521 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  18.98 
 
 		 3472 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  18.98 
 
 		 3471 aa  50.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  26.25 
 
 		 444 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>