More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1424 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1424  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 439 aa  882    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0241  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1620  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0948  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 308 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2656  transcriptional regulator  99.68 
 
 		 308 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2517  transcriptional regulator  99.68 
 
 		 308 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0156688  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0519  LysR family transcriptional regulator  93.31 
 
 		 329 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5526  LysR family transcriptional regulator  75.83 
 
 		 306 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3690  LysR family transcriptional regulator  76.16 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3724  LysR family transcriptional regulator  72.19 
 
 		 307 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2296  LysR family transcriptional regulator  72.61 
 
 		 309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.671395 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4563  LysR family transcriptional regulator  72.19 
 
 		 307 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3800  LysR family transcriptional regulator  72.19 
 
 		 307 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 314 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2206  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 300 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 314 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2073  transcriptional regulator, LysR family protein  37.33 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0794  transcriptional regulator, LysR family protein  35.49 
 
 		 301 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  42.27 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 313 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2331  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 307 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 308 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5043  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 303 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  31.89 
 
 		 300 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 314 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.34 
 
 		 309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 305 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46330  putative transcriptional regulator  35.31 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  37.31 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3942  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1974  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 317 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0100  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  0.148828 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2213  transcriptional regulator, LysR family protein  32.59 
 
 		 326 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 315 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3412  regulatory protein, LysR  32.54 
 
 		 317 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.366877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.76 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0636  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  34.36 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 314 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5082  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 301 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3222  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 301 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5845  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 301 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5015  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 301 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4334  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 301 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106421  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3034  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 301 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0386168  normal  0.816732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3073  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 355 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2309  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 355 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1329  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 355 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1042  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 355 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110992  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3200  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  67.31 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  29.73 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 310 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 305 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1771  hypothetical protein  63.25 
 
 		 307 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.24 
 
 		 300 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 305 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2020  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 311 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1414  LysR family regulatory protein  32.99 
 
 		 311 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5308  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 301 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 318 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 305 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 301 aa  130  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 314 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  33.9 
 
 		 304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2308  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611002  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03220  Transcriptional regulator  29.41 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37140  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000373718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2640  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 325 aa  127  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>