More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5074 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  614  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  75.66 
 
 		 316 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  75 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0690  LysR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64780  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.01 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 320 aa  208  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.04 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5625  putative transcriptional regulator  41.03 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1024  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.849003  normal  0.711621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  39.73 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3909  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  38.57 
 
 		 304 aa  195  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.46 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3034  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0386168  normal  0.816732 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5043  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5082  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 307 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 307 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 307 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5845  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 301 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 307 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 307 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5015  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 301 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3222  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6434  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4334  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106421  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 308 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  35.33 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4733  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  38.21 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6126  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 320 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 320 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01658  transcriptional regulator transcription regulator protein  36.88 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1550  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5891  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384931  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5527  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6019  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 303 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176233  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0307  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291876  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6400  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1897  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0520736  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5290  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 332 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1544  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>