More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2999 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 333 aa  673    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 307 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  50.97 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 307 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 307 aa  331  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 307 aa  331  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 307 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 307 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 308 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 307 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 307 aa  328  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  52.3 
 
 		 308 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2243  transcription regulator protein  51.6 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2055  transcriptional regulator, LysR family  51.13 
 
 		 325 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2448  transcriptional regulator, LysR family  49.68 
 
 		 325 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5290  LysR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 308 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 308 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 309 aa  268  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 345 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1942  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000680141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.96 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1024  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.849003  normal  0.711621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 318 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  37.21 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.76 
 
 		 300 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1550  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 432 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6126  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 301 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  34.28 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6400  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5891  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384931  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5527  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4508  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  0.61755 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6242  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3909  transcriptional regulator, LysR family  38.69 
 
 		 306 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6019  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176233  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6527  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  34.21 
 
 		 305 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  34.21 
 
 		 305 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1544  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64780  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5625  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4339  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.21 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 308 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  35.45 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5308  transcriptional regulator, LysR family  30.79 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.67 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  32.14 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  30.33 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 298 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>