More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5290 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5290  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  666    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  96.1 
 
 		 308 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  95.78 
 
 		 308 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  95.45 
 
 		 308 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  95.13 
 
 		 308 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  96.43 
 
 		 308 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  95.78 
 
 		 308 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 307 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 307 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 307 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 307 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 307 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 307 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 308 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  83.44 
 
 		 307 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  79.55 
 
 		 307 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  78.69 
 
 		 309 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  76.39 
 
 		 309 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2448  transcriptional regulator, LysR family  65.07 
 
 		 325 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2243  transcription regulator protein  64.72 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2055  transcriptional regulator, LysR family  65.07 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  52.48 
 
 		 333 aa  322  6e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1942  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000680141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 432 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.09 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 301 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  40.2 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 		 305 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 		 305 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 332 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.26 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6126  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_003296  RS01658  transcriptional regulator transcription regulator protein  38.32 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6400  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6019  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176233  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 314 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5891  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384931  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5527  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4508  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  0.61755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1024  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.849003  normal  0.711621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1550  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6242  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6527  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3909  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4339  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.88 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  36.09 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1544  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5308  transcriptional regulator, LysR family  33.12 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 310 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  36.72 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64780  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  39.6 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5625  putative transcriptional regulator  36.03 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5043  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  37.37 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  37.37 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.21 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>