More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  100 
 
 		 304 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  98.03 
 
 		 304 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0484  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 328 aa  241  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3640  transcriptional regulator, LysR family  46.23 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0175  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 309 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1973  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2824  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 302 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0138  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3679  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4324  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122962  normal  0.0785819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1318  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5245  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.204558 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4260  LysR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 308 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4140  LysR family transcriptional regulator  49 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 306 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  35.53 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.52 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1167  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.25 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.71 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 310 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 316 aa  165  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 312 aa  165  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  34.56 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 345 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  39.33 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  34.58 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 300 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  35.57 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4334  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106421  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 329 aa  159  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0702  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 315 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>