More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3034 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3034  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  614  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0386168  normal  0.816732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3222  LysR family transcriptional regulator  95.02 
 
 		 301 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5082  LysR family transcriptional regulator  94.68 
 
 		 301 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5845  LysR family transcriptional regulator  93.69 
 
 		 301 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5015  LysR family transcriptional regulator  93.69 
 
 		 301 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4334  LysR family transcriptional regulator  94.3 
 
 		 301 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106421  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  91.28 
 
 		 315 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5043  LysR family transcriptional regulator  69.33 
 
 		 303 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 298 aa  341  8e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 307 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 308 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 308 aa  324  9e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 310 aa  315  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 311 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  48.83 
 
 		 310 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.83 
 
 		 309 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  49.15 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  44.67 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  45.03 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  44.7 
 
 		 314 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  44.63 
 
 		 321 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2206  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3942  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 310 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2073  transcriptional regulator, LysR family protein  36.73 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46330  putative transcriptional regulator  39.32 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  37.04 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0794  transcriptional regulator, LysR family protein  34.59 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.12 
 
 		 300 aa  178  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  34.23 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 331 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64780  putative transcriptional regulator  35.99 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2331  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1024  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.849003  normal  0.711621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5625  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5308  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 432 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 306 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 314 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  33.9 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1897  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0520736  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3185  putative transcriptional regulator  35.42 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3724  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3800  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4563  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  35.15 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>