More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2308 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2308  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
311 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611002  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1329  LysR family transcriptional regulator  96.46 
 
 
355 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2309  LysR family transcriptional regulator  96.46 
 
 
355 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3073  LysR family transcriptional regulator  96.46 
 
 
355 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1042  LysR family transcriptional regulator  96.46 
 
 
355 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2020  LysR family transcriptional regulator  96.46 
 
 
311 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1414  LysR family regulatory protein  96.46 
 
 
311 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3200  LysR family transcriptional regulator  96.14 
 
 
355 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37140  LysR family transcriptional regulator  67.02 
 
 
301 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000373718  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3185  putative transcriptional regulator  65.6 
 
 
301 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
305 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  34.69 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  36.6 
 
 
321 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  35.6 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 
305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 
305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
307 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
318 aa  178  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.35 
 
 
300 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
312 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  35.41 
 
 
309 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.65 
 
 
309 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
311 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
320 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
320 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
314 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
345 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1974  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.22 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
301 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3942  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
310 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
319 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
334 aa  168  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 
314 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3412  regulatory protein, LysR  31.63 
 
 
317 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.366877  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 
298 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  37.16 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0084  leucine transcriptional activator  34.81 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0081  leucine transcriptional activator  34.81 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3947  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
309 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0081  leucine transcriptional activator  34.81 
 
 
314 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.669516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
302 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0078  leucine transcriptional activator  34.81 
 
 
314 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
306 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00078  leucine transcriptional activator  34.81 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3523  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00077  hypothetical protein  34.81 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  37.37 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3581  leucine transcriptional activator  34.81 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.000946626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
297 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00823  leucine transcriptional activator  33.44 
 
 
319 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
314 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
332 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01658  transcriptional regulator transcription regulator protein  34.62 
 
 
308 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001651  transcriptional regulator LysR family  33.44 
 
 
319 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
301 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
315 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2061  leucine transcriptional activator  33.55 
 
 
321 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
313 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
315 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
310 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
309 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
299 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2934  leucine transcriptional activator  33.91 
 
 
322 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.594963  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
310 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 
316 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3403  leucine transcriptional activator  33.91 
 
 
318 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3533  leucine transcriptional activator  33.91 
 
 
318 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
307 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
299 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2749  leucine transcriptional activator  32.77 
 
 
324 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 
310 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  34.35 
 
 
319 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3118  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
310 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
317 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2073  transcriptional regulator, LysR family protein  32.08 
 
 
303 aa  155  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3640  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
327 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.525425  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
432 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
306 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 
304 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
326 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0310  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
308 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0131  leucine transcriptional activator  34.13 
 
 
314 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0678941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3034  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
301 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0386168  normal  0.816732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3757  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
297 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200349  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
305 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4334  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
301 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106421  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5845  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
301 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151621  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5015  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
301 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
314 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>