27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1771 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1771  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1424  LysR family transcriptional regulator  71.58 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2228  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  28.64 
 
 
522 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  43.21 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0962  hypothetical protein  57.65 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0083  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
1067 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.148961  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0470  hypothetical protein  28.99 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0304646  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1945  hypothetical protein  58.23 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0290  hypothetical protein  52.81 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0789  hypothetical protein  42.98 
 
 
193 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.591318  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  28.81 
 
 
257 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0607  hypothetical protein  64 
 
 
78 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101449  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  22.11 
 
 
335 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  17.84 
 
 
1475 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6356  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  26.4 
 
 
400 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  22.43 
 
 
718 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.05 
 
 
1474 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  23.81 
 
 
173 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1188  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.2 
 
 
1354 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5830  hypothetical protein  23.33 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123133  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0065  hypothetical protein  26.67 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  29.63 
 
 
1984 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  37.86 
 
 
469 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1062  hypothetical protein  41.77 
 
 
792 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1412  hypothetical protein  60.53 
 
 
99 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0485  hypothetical protein  42.25 
 
 
575 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0206204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>