31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3389 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  36.08 
 
 		 704 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  29.09 
 
 		 941 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  28.64 
 
 		 846 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  30.39 
 
 		 857 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  30.39 
 
 		 857 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  30.39 
 
 		 907 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  29.05 
 
 		 848 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  28.73 
 
 		 915 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  29.94 
 
 		 762 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  29.83 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  29.83 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  28.89 
 
 		 835 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  29.63 
 
 		 874 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  28.92 
 
 		 769 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  28.72 
 
 		 856 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  29.38 
 
 		 787 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  28.89 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  28.57 
 
 		 871 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  27.57 
 
 		 858 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  28.18 
 
 		 857 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  28.19 
 
 		 856 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  27.12 
 
 		 799 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  23.7 
 
 		 848 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  27.12 
 
 		 799 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  25 
 
 		 586 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  24.72 
 
 		 790 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  27.03 
 
 		 855 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  27.91 
 
 		 842 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  27.57 
 
 		 554 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  21.84 
 
 		 784 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>