46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0894 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  98.64 
 
 
857 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  100 
 
 
367 aa  721    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  98.91 
 
 
857 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  98.91 
 
 
907 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  94.82 
 
 
915 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  76.8 
 
 
858 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  80.69 
 
 
857 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  79.75 
 
 
856 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  80 
 
 
904 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  78.5 
 
 
856 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  71.58 
 
 
848 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  78.4 
 
 
855 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  71.58 
 
 
874 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  73.29 
 
 
871 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  62.06 
 
 
787 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  57.91 
 
 
941 aa  352  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  62.46 
 
 
799 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  62.11 
 
 
799 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  53.85 
 
 
769 aa  335  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  52.04 
 
 
835 aa  328  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  52.55 
 
 
846 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  52.35 
 
 
842 aa  316  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  46.69 
 
 
762 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  48.09 
 
 
639 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  43.99 
 
 
790 aa  262  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  41.85 
 
 
719 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  38 
 
 
740 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  37.42 
 
 
741 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  36.48 
 
 
680 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  36.33 
 
 
704 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  26.48 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  46.05 
 
 
488 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  53.95 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  25.53 
 
 
784 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  50.65 
 
 
490 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  22.9 
 
 
848 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  48 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  49.35 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  47.95 
 
 
341 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  43.42 
 
 
438 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  49.32 
 
 
485 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  49.32 
 
 
473 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  49.32 
 
 
487 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  29.83 
 
 
209 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  28.07 
 
 
586 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>