123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1276 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  100 
 
 		 1049 aa  2042    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  30.71 
 
 		 909 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  34.62 
 
 		 818 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  35.1 
 
 		 1040 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  33.83 
 
 		 1099 aa  168  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  33.16 
 
 		 1093 aa  167  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  33.16 
 
 		 1093 aa  167  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  32.1 
 
 		 1115 aa  162  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  34.4 
 
 		 947 aa  160  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  33.52 
 
 		 819 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  33.24 
 
 		 825 aa  156  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  33.43 
 
 		 924 aa  154  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.41 
 
 		 1055 aa  152  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  34.82 
 
 		 1748 aa  149  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  35.64 
 
 		 1234 aa  149  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  34.97 
 
 		 1762 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  34.97 
 
 		 1762 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  34.85 
 
 		 1763 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  31.13 
 
 		 864 aa  146  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  36.76 
 
 		 1753 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  34.16 
 
 		 1770 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  37.3 
 
 		 1770 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  30.12 
 
 		 3322 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  30.14 
 
 		 1741 aa  127  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  31.82 
 
 		 1579 aa  120  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  35.6 
 
 		 1594 aa  119  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  35.44 
 
 		 356 aa  105  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  31.76 
 
 		 1067 aa  102  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  31.76 
 
 		 1070 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  37.99 
 
 		 927 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  31.45 
 
 		 1070 aa  99  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  31.3 
 
 		 1028 aa  95.1  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.7 
 
 		 1357 aa  93.6  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  45.63 
 
 		 914 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  28.54 
 
 		 995 aa  89  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  39.16 
 
 		 2449 aa  88.2  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.36 
 
 		 1039 aa  86.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  27.85 
 
 		 950 aa  83.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  25 
 
 		 820 aa  83.2  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.04 
 
 		 806 aa  82  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  37.93 
 
 		 3415 aa  80.9  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  37.24 
 
 		 3420 aa  80.1  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  27.93 
 
 		 358 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  27.59 
 
 		 358 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  27.93 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  25.33 
 
 		 773 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  31.91 
 
 		 1602 aa  75.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  47.12 
 
 		 1277 aa  75.1  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.16 
 
 		 1086 aa  75.1  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  45.45 
 
 		 2057 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  27.45 
 
 		 358 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  26.61 
 
 		 1012 aa  73.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  29.65 
 
 		 506 aa  73.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  48.45 
 
 		 2397 aa  72.8  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  29.65 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.6 
 
 		 868 aa  72.4  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.79 
 
 		 1197 aa  71.6  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  32.2 
 
 		 989 aa  70.1  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  41.88 
 
 		 2179 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  39.81 
 
 		 4312 aa  68.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  32.73 
 
 		 955 aa  68.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  27.16 
 
 		 1971 aa  68.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  42.86 
 
 		 2637 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  38.83 
 
 		 4391 aa  67  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  30.09 
 
 		 729 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  32.12 
 
 		 955 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  33.55 
 
 		 1102 aa  66.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 1113 aa  65.9  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  35.29 
 
 		 949 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  32 
 
 		 948 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  34.69 
 
 		 2926 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.45 
 
 		 1023 aa  63.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  39.45 
 
 		 1327 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  40.17 
 
 		 2272 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  39.45 
 
 		 1327 aa  63.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  39.45 
 
 		 1349 aa  62.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  34.21 
 
 		 861 aa  62.4  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  35.56 
 
 		 1571 aa  62  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  35.43 
 
 		 948 aa  61.6  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  25.95 
 
 		 1108 aa  61.2  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  35.17 
 
 		 1806 aa  61.2  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4666  hypothetical protein  34.69 
 
 		 233 aa  60.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  26.09 
 
 		 1259 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  35.43 
 
 		 948 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  26.09 
 
 		 1259 aa  60.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  26.59 
 
 		 1268 aa  60.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  25.82 
 
 		 1254 aa  59.7  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1165 aa  59.3  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1165 aa  59.3  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  26.08 
 
 		 2578 aa  58.9  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  34 
 
 		 1859 aa  58.9  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  25.97 
 
 		 1285 aa  58.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  34.48 
 
 		 1327 aa  58.5  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  26.22 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  34.48 
 
 		 1626 aa  58.5  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  34.51 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  25.34 
 
 		 1269 aa  58.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  26.7 
 
 		 638 aa  57.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  26.7 
 
 		 638 aa  57.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  26.08 
 
 		 1861 aa  56.6  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>