155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1888 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  99.22 
 
 		 638 aa  1272    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  99.22 
 
 		 638 aa  1272    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  100 
 
 		 638 aa  1281    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  39.57 
 
 		 759 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  39.35 
 
 		 759 aa  302  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  39.35 
 
 		 759 aa  302  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  34.23 
 
 		 709 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  34.75 
 
 		 769 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  34.86 
 
 		 733 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 		 732 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  33.26 
 
 		 731 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  33.18 
 
 		 773 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  32.43 
 
 		 729 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  34.81 
 
 		 1008 aa  228  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  36.08 
 
 		 429 aa  223  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  32.48 
 
 		 815 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  35.85 
 
 		 863 aa  220  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  35.85 
 
 		 863 aa  220  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  35.85 
 
 		 836 aa  220  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.85 
 
 		 836 aa  220  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  35.85 
 
 		 836 aa  220  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  35.9 
 
 		 863 aa  220  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  30.06 
 
 		 730 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1565 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  32.64 
 
 		 1571 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  32.35 
 
 		 1526 aa  212  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.14 
 
 		 1526 aa  208  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  32.13 
 
 		 747 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  27.3 
 
 		 800 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  28.25 
 
 		 1441 aa  179  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  28.21 
 
 		 1541 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  29.53 
 
 		 562 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  29.24 
 
 		 1117 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  26.21 
 
 		 765 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  32.91 
 
 		 236 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  25.11 
 
 		 955 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.11 
 
 		 955 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  25.11 
 
 		 955 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  25.11 
 
 		 955 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  24.79 
 
 		 961 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  23.16 
 
 		 714 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  23.02 
 
 		 680 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  23.02 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  23.02 
 
 		 681 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  23.11 
 
 		 868 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  22.51 
 
 		 1003 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  23.27 
 
 		 1000 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.29 
 
 		 1067 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  23.16 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  22.91 
 
 		 968 aa  77.4  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  22.91 
 
 		 968 aa  77.4  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  24.88 
 
 		 1070 aa  77.4  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  23.15 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  23.82 
 
 		 922 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  22.78 
 
 		 2637 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  24.82 
 
 		 1093 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  24.82 
 
 		 1093 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  24.65 
 
 		 1070 aa  74.7  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  25.25 
 
 		 1099 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  21.87 
 
 		 1594 aa  71.6  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  23.96 
 
 		 1115 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  28.11 
 
 		 950 aa  67.8  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  27.17 
 
 		 1366 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  21.41 
 
 		 1579 aa  65.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.42 
 
 		 1357 aa  64.7  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  23.03 
 
 		 1040 aa  64.3  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  23.83 
 
 		 989 aa  64.3  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  35.96 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  22.93 
 
 		 1327 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  23.44 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  23.61 
 
 		 955 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  22.68 
 
 		 1806 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3921  outer membrane autotransporter  23.34 
 
 		 1269 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  23.43 
 
 		 4391 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4650  serine protease EatA  27.12 
 
 		 1285 aa  61.6  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  25.2 
 
 		 1108 aa  61.6  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  23.61 
 
 		 955 aa  61.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  22.22 
 
 		 914 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.67 
 
 		 1741 aa  60.8  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  23.4 
 
 		 1602 aa  60.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  25.14 
 
 		 1571 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  23.5 
 
 		 1971 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  24.55 
 
 		 1004 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.6 
 
 		 806 aa  60.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.54 
 
 		 868 aa  60.1  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  24.9 
 
 		 997 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  25.28 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  35.35 
 
 		 108 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  20.97 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  22.14 
 
 		 909 aa  58.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  26.22 
 
 		 1049 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  22.37 
 
 		 2057 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  21.95 
 
 		 1300 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  24.26 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  24.26 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1165 aa  57  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1165 aa  57  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  24.76 
 
 		 358 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  23.04 
 
 		 1102 aa  57  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  24.52 
 
 		 358 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>