117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2763 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  100 
 
 		 927 aa  1858    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  69.57 
 
 		 914 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  41.72 
 
 		 909 aa  636    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  44.55 
 
 		 818 aa  646    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  42.46 
 
 		 819 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  42.45 
 
 		 825 aa  618  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.87 
 
 		 1009 aa  541  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  33.47 
 
 		 924 aa  300  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  35.82 
 
 		 1099 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  34.29 
 
 		 1093 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  34.29 
 
 		 1093 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  33.96 
 
 		 1049 aa  253  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  32.85 
 
 		 1115 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  36.81 
 
 		 864 aa  213  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  33.14 
 
 		 358 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  32.82 
 
 		 358 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  32.51 
 
 		 389 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  32.95 
 
 		 358 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  33.23 
 
 		 1040 aa  181  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  35.38 
 
 		 356 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.08 
 
 		 1055 aa  158  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.23 
 
 		 1357 aa  145  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.11 
 
 		 1741 aa  129  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  26.77 
 
 		 1594 aa  125  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.14 
 
 		 3322 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  28.74 
 
 		 947 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  26.23 
 
 		 1579 aa  108  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  25.64 
 
 		 2057 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  27.41 
 
 		 3420 aa  104  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  35.68 
 
 		 1762 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  25.45 
 
 		 820 aa  100  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  35.68 
 
 		 1762 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  26.55 
 
 		 3415 aa  100  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  35.68 
 
 		 1763 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  27.68 
 
 		 1067 aa  95.9  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  28.4 
 
 		 1070 aa  95.9  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  25.04 
 
 		 1806 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  35.86 
 
 		 1770 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  28.4 
 
 		 1070 aa  93.6  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  34.76 
 
 		 1753 aa  93.2  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  33.8 
 
 		 1770 aa  93.2  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  24.87 
 
 		 1327 aa  90.9  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  36.99 
 
 		 1748 aa  90.5  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 1023 aa  87.4  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  25.32 
 
 		 1012 aa  86.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  25.24 
 
 		 1861 aa  85.1  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  36.32 
 
 		 2926 aa  84.3  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  33.49 
 
 		 1626 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  25.92 
 
 		 2578 aa  83.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  31.56 
 
 		 1113 aa  82.8  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  25.24 
 
 		 2906 aa  82.8  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.12 
 
 		 868 aa  82.4  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  44.53 
 
 		 2637 aa  81.3  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  33.19 
 
 		 861 aa  81.3  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  24.45 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  32.69 
 
 		 773 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  35.4 
 
 		 1068 aa  78.2  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  39.58 
 
 		 1277 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  34.39 
 
 		 1327 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  34.39 
 
 		 1349 aa  75.1  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  38.18 
 
 		 1234 aa  74.3  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1165 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  31.76 
 
 		 1571 aa  74.3  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.91 
 
 		 950 aa  74.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1165 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  33.86 
 
 		 1327 aa  72.8  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.04 
 
 		 1197 aa  72.8  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  43.3 
 
 		 268 aa  70.5  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  33.64 
 
 		 1108 aa  69.3  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  22.71 
 
 		 1004 aa  68.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  30.47 
 
 		 1593 aa  68.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  27.47 
 
 		 989 aa  65.5  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  32.11 
 
 		 995 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  33.94 
 
 		 4312 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  25.59 
 
 		 759 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  34.1 
 
 		 1254 aa  63.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  25.59 
 
 		 759 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  25.25 
 
 		 759 aa  62.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  34.1 
 
 		 1269 aa  62.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  26.36 
 
 		 1102 aa  62.4  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  33.03 
 
 		 4391 aa  62  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  25.35 
 
 		 638 aa  61.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  25.35 
 
 		 638 aa  61.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  34.1 
 
 		 1259 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  39.05 
 
 		 948 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  39.05 
 
 		 948 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  25.35 
 
 		 638 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  39.05 
 
 		 948 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  30.39 
 
 		 955 aa  61.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  39.05 
 
 		 949 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  23.47 
 
 		 1971 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  33.53 
 
 		 1259 aa  58.9  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.93 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  29.83 
 
 		 955 aa  58.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0670  hypothetical protein  36.73 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  33.13 
 
 		 1285 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  34.92 
 
 		 1234 aa  57  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  26.79 
 
 		 997 aa  56.2  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.88 
 
 		 1039 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  27.64 
 
 		 938 aa  54.3  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>