60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1818 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  86.31 
 
 		 389 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  87.71 
 
 		 358 aa  646    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 358 aa  731    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  86.03 
 
 		 358 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  42.78 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  36.07 
 
 		 914 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  33.14 
 
 		 927 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  31.83 
 
 		 909 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  28.53 
 
 		 818 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  29.12 
 
 		 825 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  29.12 
 
 		 819 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  28.28 
 
 		 864 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.03 
 
 		 1009 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  28.4 
 
 		 1099 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  28.83 
 
 		 1115 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  30.34 
 
 		 1040 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  27.68 
 
 		 1093 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  27.68 
 
 		 1093 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  23.17 
 
 		 924 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  27.63 
 
 		 1049 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.32 
 
 		 1055 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.78 
 
 		 1741 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.54 
 
 		 947 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.33 
 
 		 1357 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  21.59 
 
 		 759 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  25.42 
 
 		 2057 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  28.21 
 
 		 1067 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  28.21 
 
 		 1070 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  25 
 
 		 638 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 638 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  24.7 
 
 		 1748 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  26.39 
 
 		 1770 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  21.21 
 
 		 759 aa  57  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  27.69 
 
 		 1070 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  24.52 
 
 		 638 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.39 
 
 		 1753 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.39 
 
 		 1770 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  21.54 
 
 		 759 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  23.55 
 
 		 989 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  25.93 
 
 		 1762 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  25.93 
 
 		 1762 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  25.93 
 
 		 1763 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  23.12 
 
 		 820 aa  52.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  27.59 
 
 		 769 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  27.81 
 
 		 732 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1571 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  24.37 
 
 		 765 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  26.44 
 
 		 709 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  23.29 
 
 		 466 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  23.58 
 
 		 729 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.77 
 
 		 1197 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  29.81 
 
 		 1526 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  28.66 
 
 		 236 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.81 
 
 		 1526 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  26 
 
 		 1008 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  24.2 
 
 		 731 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  27.92 
 
 		 773 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1565 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  25.95 
 
 		 955 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  23.29 
 
 		 1327 aa  43.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>