137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2492 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  69.61 
 
 		 927 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 914 aa  1827    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  42.04 
 
 		 909 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  43.6 
 
 		 818 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.08 
 
 		 1009 aa  592  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  45.56 
 
 		 825 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  44.27 
 
 		 819 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  32.12 
 
 		 924 aa  296  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  33.8 
 
 		 1049 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  35.91 
 
 		 1093 aa  222  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  35.91 
 
 		 1093 aa  222  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  35.28 
 
 		 1099 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  37.62 
 
 		 1115 aa  211  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  36.07 
 
 		 358 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  39.08 
 
 		 356 aa  200  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  34.6 
 
 		 358 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  34.6 
 
 		 389 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  34.39 
 
 		 358 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  35.17 
 
 		 1040 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.24 
 
 		 1055 aa  186  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  33.43 
 
 		 864 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  31.25 
 
 		 947 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.37 
 
 		 1741 aa  124  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.46 
 
 		 3322 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.56 
 
 		 820 aa  105  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.53 
 
 		 1357 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  36.23 
 
 		 3420 aa  100  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.59 
 
 		 868 aa  100  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  25.93 
 
 		 1594 aa  99.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  37.61 
 
 		 1762 aa  98.6  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  37.61 
 
 		 1762 aa  98.6  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  25.83 
 
 		 1579 aa  98.6  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  37.61 
 
 		 1763 aa  98.6  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  53.85 
 
 		 268 aa  98.2  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  36.15 
 
 		 1753 aa  97.8  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  35.75 
 
 		 3415 aa  97.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  40.31 
 
 		 1748 aa  97.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  36.75 
 
 		 1571 aa  95.9  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  36.74 
 
 		 1770 aa  95.5  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  27.36 
 
 		 1067 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  39.23 
 
 		 1770 aa  93.2  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  27.36 
 
 		 1070 aa  92.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  27.51 
 
 		 1070 aa  90.5  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  27.14 
 
 		 989 aa  89.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.41 
 
 		 1023 aa  89.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  26.01 
 
 		 1012 aa  89.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  36.45 
 
 		 995 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  38.98 
 
 		 950 aa  85.5  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  42.42 
 
 		 773 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  37.17 
 
 		 2926 aa  83.2  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  35.75 
 
 		 1806 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1165 aa  82.4  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1165 aa  82.4  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 1068 aa  80.9  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.57 
 
 		 1197 aa  79.7  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  35.2 
 
 		 1626 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  37.01 
 
 		 1327 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  33.16 
 
 		 861 aa  78.2  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  33.16 
 
 		 1113 aa  77  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  32.92 
 
 		 1861 aa  75.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  44.86 
 
 		 948 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  36.17 
 
 		 2906 aa  75.5  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  38.41 
 
 		 1108 aa  75.5  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  36.17 
 
 		 2578 aa  75.1  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  31.73 
 
 		 4312 aa  75.5  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  32.86 
 
 		 1234 aa  74.7  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  34.75 
 
 		 4391 aa  75.1  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  45.45 
 
 		 949 aa  74.7  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  39.58 
 
 		 1277 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  43.93 
 
 		 948 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  43.93 
 
 		 948 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  25.13 
 
 		 1349 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  46.79 
 
 		 2057 aa  72.4  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  39.26 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.38 
 
 		 1039 aa  72  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  33.5 
 
 		 1593 aa  72  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  51.72 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  51.72 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  27.43 
 
 		 1971 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  38.51 
 
 		 2637 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.37 
 
 		 1086 aa  68.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  21.27 
 
 		 1004 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  39.17 
 
 		 1028 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  25.7 
 
 		 1327 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  25.65 
 
 		 1327 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  34.62 
 
 		 955 aa  65.1  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  37.84 
 
 		 955 aa  64.7  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  25.07 
 
 		 759 aa  62.4  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  38.3 
 
 		 444 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  33.08 
 
 		 1102 aa  62  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.84 
 
 		 806 aa  62  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  27.71 
 
 		 729 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  22.92 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  25.07 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  22.92 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  22.92 
 
 		 638 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  24.78 
 
 		 759 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  32.35 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  38.1 
 
 		 1254 aa  58.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  28.86 
 
 		 997 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>