137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4077 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  96.07 
 
 
1067 aa  2054    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  100 
 
 
1070 aa  2139    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  97.29 
 
 
1070 aa  2016    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  33.68 
 
 
1762 aa  319  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  33.68 
 
 
1762 aa  319  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  32.62 
 
 
1770 aa  318  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  34.48 
 
 
1763 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  32.08 
 
 
1770 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  34.04 
 
 
1753 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  31.31 
 
 
1748 aa  302  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  27.02 
 
 
1008 aa  239  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  28.73 
 
 
947 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.52 
 
 
1023 aa  219  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  27.4 
 
 
1040 aa  198  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  31.26 
 
 
1099 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  30.64 
 
 
1115 aa  156  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  25.75 
 
 
1594 aa  151  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  31.44 
 
 
820 aa  147  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  28.74 
 
 
825 aa  139  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  30.26 
 
 
3415 aa  137  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  30.26 
 
 
3420 aa  135  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  28.32 
 
 
819 aa  135  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  28.17 
 
 
818 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  30.93 
 
 
2926 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  24.78 
 
 
1579 aa  120  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  28.74 
 
 
909 aa  119  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 
1012 aa  119  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  24.95 
 
 
1234 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.26 
 
 
868 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.55 
 
 
1086 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  25.6 
 
 
864 aa  115  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  30.33 
 
 
1259 aa  114  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  30.33 
 
 
1285 aa  114  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.36 
 
 
1327 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.68 
 
 
950 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  31.1 
 
 
1254 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  30.63 
 
 
1269 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  28.36 
 
 
1806 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  30.49 
 
 
1259 aa  111  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.68 
 
 
729 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  27.53 
 
 
730 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  29.73 
 
 
1268 aa  110  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  28.16 
 
 
989 aa  109  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  24.97 
 
 
995 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  28.36 
 
 
466 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  25.32 
 
 
1113 aa  105  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  26.67 
 
 
2637 aa  105  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  27.41 
 
 
4391 aa  104  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  28.01 
 
 
924 aa  104  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  27.41 
 
 
4312 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  25.66 
 
 
773 aa  102  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  27.73 
 
 
914 aa  102  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.19 
 
 
1039 aa  102  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  29.03 
 
 
1571 aa  102  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  27.18 
 
 
2578 aa  102  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  27.39 
 
 
2906 aa  99.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  24.59 
 
 
1028 aa  100  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  24.89 
 
 
709 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  31.25 
 
 
1049 aa  99.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  28.27 
 
 
927 aa  99  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  27.02 
 
 
1861 aa  97.8  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  26.17 
 
 
773 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  27.07 
 
 
1108 aa  95.1  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  26.73 
 
 
1068 aa  92.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  35.81 
 
 
1626 aa  92.4  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  27.58 
 
 
1593 aa  91.7  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  26.89 
 
 
732 aa  91.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  25.88 
 
 
948 aa  91.7  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.05 
 
 
1055 aa  90.9  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  27.12 
 
 
1741 aa  90.1  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  25.68 
 
 
1165 aa  89  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  25.68 
 
 
1165 aa  89  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  25.51 
 
 
949 aa  89.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  27.04 
 
 
948 aa  89  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.91 
 
 
1357 aa  88.2  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  26.26 
 
 
948 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.64 
 
 
769 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  25.88 
 
 
2057 aa  84.7  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  23.72 
 
 
955 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.72 
 
 
955 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  24.1 
 
 
955 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.29 
 
 
1009 aa  84  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  25.37 
 
 
1349 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  24.53 
 
 
638 aa  83.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  25.37 
 
 
1327 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.3 
 
 
1197 aa  83.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  25.29 
 
 
638 aa  84  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  24.53 
 
 
638 aa  83.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  27.63 
 
 
1277 aa  83.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  23.59 
 
 
955 aa  82.8  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  25.16 
 
 
1327 aa  81.6  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  24.31 
 
 
733 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.27 
 
 
806 aa  76.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  26.96 
 
 
861 aa  73.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  26.85 
 
 
955 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  23.25 
 
 
759 aa  73.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  27.6 
 
 
955 aa  73.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  23.25 
 
 
759 aa  72.8  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  24.13 
 
 
731 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  23.25 
 
 
759 aa  72  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>