63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4057 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  86.31 
 
 		 358 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 389 aa  798    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  98.04 
 
 		 358 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  91.62 
 
 		 358 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  44.51 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  35.09 
 
 		 914 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  32.6 
 
 		 927 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  31.27 
 
 		 909 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  28.9 
 
 		 818 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  28.75 
 
 		 819 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  28.75 
 
 		 825 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  24.55 
 
 		 864 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.64 
 
 		 1009 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  29.81 
 
 		 1099 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  27.39 
 
 		 1040 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  29.64 
 
 		 1115 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  30.71 
 
 		 1093 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  30.71 
 
 		 1093 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  27.93 
 
 		 1049 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  23.17 
 
 		 924 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  28.08 
 
 		 947 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.63 
 
 		 1055 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.18 
 
 		 1741 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  22.78 
 
 		 759 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.18 
 
 		 1357 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  22.39 
 
 		 759 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  22.7 
 
 		 820 aa  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  22.66 
 
 		 759 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.69 
 
 		 1067 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  26.69 
 
 		 1070 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  26.29 
 
 		 1070 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  24.75 
 
 		 638 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  24.75 
 
 		 638 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  25.97 
 
 		 1770 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  25.97 
 
 		 1770 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  24.26 
 
 		 638 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  25.58 
 
 		 1748 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  22.94 
 
 		 3322 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.07 
 
 		 1753 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  22.98 
 
 		 989 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  25.66 
 
 		 2057 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  27.59 
 
 		 769 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  25.51 
 
 		 1763 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  26.71 
 
 		 729 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  25.51 
 
 		 1762 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  25.51 
 
 		 1762 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  27.01 
 
 		 709 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  27.32 
 
 		 732 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  26.67 
 
 		 1008 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  22.86 
 
 		 1327 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  23.19 
 
 		 765 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  23.47 
 
 		 731 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  24.63 
 
 		 730 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  22.29 
 
 		 1806 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 4312 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  27.78 
 
 		 733 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  26.47 
 
 		 773 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  24.22 
 
 		 3415 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1571 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  23.03 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  24.22 
 
 		 3420 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  28.97 
 
 		 1526 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.97 
 
 		 1526 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>