149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2034 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  51.02 
 
 		 730 aa  718    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  54.05 
 
 		 773 aa  781    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 732 aa  1454    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  53.17 
 
 		 729 aa  735    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  54.23 
 
 		 731 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  54.38 
 
 		 733 aa  739    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  47.8 
 
 		 747 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  44.43 
 
 		 709 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  44.19 
 
 		 769 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  39.23 
 
 		 1008 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  33.62 
 
 		 863 aa  262  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  33.62 
 
 		 863 aa  263  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  33.62 
 
 		 836 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.62 
 
 		 836 aa  262  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  33.62 
 
 		 836 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  35.37 
 
 		 429 aa  259  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  35.68 
 
 		 863 aa  256  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  33.56 
 
 		 638 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  33.56 
 
 		 638 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  33.92 
 
 		 759 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1571 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  33.92 
 
 		 759 aa  241  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  33.33 
 
 		 638 aa  240  6.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1565 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  32.14 
 
 		 1526 aa  238  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.14 
 
 		 1526 aa  238  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  33.48 
 
 		 759 aa  236  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  32.23 
 
 		 1541 aa  223  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  32.13 
 
 		 1117 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  32.23 
 
 		 1441 aa  221  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  28.93 
 
 		 562 aa  218  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  29.7 
 
 		 765 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  38.66 
 
 		 236 aa  160  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  28.61 
 
 		 868 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  28.61 
 
 		 681 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  28.68 
 
 		 680 aa  148  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  26.25 
 
 		 815 aa  147  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  28.39 
 
 		 1003 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  28.68 
 
 		 470 aa  147  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  25.32 
 
 		 800 aa  140  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  26.53 
 
 		 714 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  26.56 
 
 		 1000 aa  127  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  27.37 
 
 		 955 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.37 
 
 		 955 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  27.37 
 
 		 955 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  27.37 
 
 		 955 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  26.05 
 
 		 968 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  26.05 
 
 		 968 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  25.99 
 
 		 922 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  26.53 
 
 		 465 aa  125  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  26.53 
 
 		 398 aa  125  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.78 
 
 		 947 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  26.22 
 
 		 961 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.97 
 
 		 1753 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  26.74 
 
 		 1762 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  26.74 
 
 		 1762 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  28.35 
 
 		 1748 aa  108  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  27.06 
 
 		 1770 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  27.02 
 
 		 1763 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  26.39 
 
 		 1770 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  24.68 
 
 		 1602 aa  99.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.34 
 
 		 806 aa  98.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.26 
 
 		 1067 aa  94.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  26.22 
 
 		 1070 aa  92  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  25.65 
 
 		 1070 aa  91.3  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  23.87 
 
 		 1327 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  40.52 
 
 		 136 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  24.68 
 
 		 1366 aa  84  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  23.01 
 
 		 1806 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  24.49 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  23.19 
 
 		 1594 aa  77.8  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  27.65 
 
 		 955 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  40.19 
 
 		 108 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  27.13 
 
 		 4391 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  42 
 
 		 108 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  27.55 
 
 		 955 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  27.13 
 
 		 4312 aa  75.1  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.79 
 
 		 1023 aa  74.7  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  24.16 
 
 		 1277 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 		 1234 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  30.05 
 
 		 818 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  23.24 
 
 		 989 aa  65.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.7 
 
 		 868 aa  63.9  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  26.71 
 
 		 1571 aa  64.3  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  25.86 
 
 		 1579 aa  63.9  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  23.3 
 
 		 1300 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 		 1093 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1093 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  29.06 
 
 		 819 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.68 
 
 		 1055 aa  62  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.6 
 
 		 1234 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  23.67 
 
 		 1040 aa  61.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  23.51 
 
 		 2637 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  23 
 
 		 1250 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 825 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  23.38 
 
 		 995 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  24.22 
 
 		 1234 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  23.3 
 
 		 1099 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  21.8 
 
 		 1254 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  23.44 
 
 		 1234 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>