67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1179 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  84.62 
 
 		 1441 aa  1447    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  55.52 
 
 		 1117 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  100 
 
 		 1541 aa  3040    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1287  pertactin  87.97 
 
 		 454 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  62.43 
 
 		 562 aa  702    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  33.96 
 
 		 733 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1571 aa  229  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1565 aa  227  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  32.86 
 
 		 731 aa  224  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  32.23 
 
 		 732 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  32.8 
 
 		 773 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  27.91 
 
 		 1526 aa  219  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.91 
 
 		 1526 aa  218  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  32.54 
 
 		 729 aa  218  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  33.19 
 
 		 747 aa  213  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  28.29 
 
 		 863 aa  207  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  30.08 
 
 		 863 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.89 
 
 		 836 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  27.89 
 
 		 836 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  27.89 
 
 		 836 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  27.89 
 
 		 863 aa  203  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  32.27 
 
 		 769 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  31.42 
 
 		 730 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  29.72 
 
 		 709 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  31.56 
 
 		 759 aa  199  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  33.83 
 
 		 429 aa  199  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  31.33 
 
 		 759 aa  197  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  31.11 
 
 		 759 aa  196  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  28.38 
 
 		 638 aa  185  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  28.38 
 
 		 638 aa  185  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  28.38 
 
 		 638 aa  184  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  29.76 
 
 		 1008 aa  176  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  34.32 
 
 		 236 aa  126  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  26.22 
 
 		 765 aa  116  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  29.18 
 
 		 815 aa  114  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  29.08 
 
 		 800 aa  109  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  28.86 
 
 		 714 aa  105  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  27.85 
 
 		 1000 aa  97.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  26.99 
 
 		 868 aa  95.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  26.82 
 
 		 681 aa  95.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  26.71 
 
 		 680 aa  95.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 		 968 aa  94.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  27.85 
 
 		 968 aa  94.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  27.85 
 
 		 465 aa  94.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  27.85 
 
 		 922 aa  94.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  26.7 
 
 		 470 aa  94.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  27.85 
 
 		 398 aa  94  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  26.76 
 
 		 1003 aa  93.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  24.09 
 
 		 955 aa  71.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  24.09 
 
 		 955 aa  71.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  24.09 
 
 		 955 aa  71.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.09 
 
 		 955 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  24.61 
 
 		 961 aa  66.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  22.79 
 
 		 2325 aa  62  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  30.28 
 
 		 1004 aa  55.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  30.28 
 
 		 997 aa  55.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  35.19 
 
 		 108 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  27.24 
 
 		 955 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  23.29 
 
 		 1602 aa  49.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  26.87 
 
 		 955 aa  49.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.7 
 
 		 1039 aa  48.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  26.27 
 
 		 994 aa  47.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  25.65 
 
 		 1099 aa  46.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  25.26 
 
 		 380 aa  45.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.52 
 
 		 1115 aa  45.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>