112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2897 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  48.9 
 
 		 773 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  47.8 
 
 		 732 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 747 aa  1486    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  50.13 
 
 		 731 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  50.51 
 
 		 733 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  46.29 
 
 		 729 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  46.91 
 
 		 730 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  41 
 
 		 709 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  38.95 
 
 		 769 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  37.33 
 
 		 1008 aa  342  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  35.54 
 
 		 863 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  35.54 
 
 		 863 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  34.73 
 
 		 759 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  35.54 
 
 		 836 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.54 
 
 		 836 aa  239  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  35.54 
 
 		 836 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  36.09 
 
 		 863 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  34.51 
 
 		 759 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  35.54 
 
 		 429 aa  237  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  34.07 
 
 		 759 aa  233  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  34.75 
 
 		 1541 aa  228  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  34.28 
 
 		 1441 aa  223  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1571 aa  220  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  31.47 
 
 		 638 aa  217  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  31.47 
 
 		 638 aa  217  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1565 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  32.13 
 
 		 638 aa  213  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  33.57 
 
 		 1117 aa  213  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  32.8 
 
 		 562 aa  213  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  30.8 
 
 		 1526 aa  211  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.59 
 
 		 1526 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  26.88 
 
 		 815 aa  152  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  25.97 
 
 		 1003 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  27.15 
 
 		 680 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  27.15 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  27.15 
 
 		 681 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  26.74 
 
 		 868 aa  138  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  35.59 
 
 		 236 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  26.34 
 
 		 714 aa  130  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  26.88 
 
 		 465 aa  124  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  26.65 
 
 		 765 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  25.94 
 
 		 968 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  25.94 
 
 		 968 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  26.08 
 
 		 922 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  26.2 
 
 		 1000 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  25.53 
 
 		 955 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.53 
 
 		 955 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  25.62 
 
 		 955 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  25.62 
 
 		 955 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  27.07 
 
 		 398 aa  120  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  22.95 
 
 		 800 aa  117  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  24.86 
 
 		 961 aa  114  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.48 
 
 		 1753 aa  88.6  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  24.84 
 
 		 947 aa  87.4  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1770 aa  87.4  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  25.06 
 
 		 1763 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  25.62 
 
 		 1762 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  25.62 
 
 		 1762 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.68 
 
 		 806 aa  85.1  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  26.15 
 
 		 1748 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  24.07 
 
 		 1770 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  23.08 
 
 		 1602 aa  80.9  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  23.92 
 
 		 1067 aa  74.3  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  32.76 
 
 		 136 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  23.9 
 
 		 1070 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  23.9 
 
 		 1070 aa  68.6  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  36.63 
 
 		 108 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  34.26 
 
 		 108 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.47 
 
 		 1023 aa  63.9  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  24.1 
 
 		 1040 aa  61.6  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  23.29 
 
 		 1300 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  22.72 
 
 		 1366 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.31 
 
 		 1489 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.22 
 
 		 1055 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  22.49 
 
 		 818 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  27.74 
 
 		 4391 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  27.74 
 
 		 4312 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4650  serine protease EatA  26.51 
 
 		 1285 aa  55.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  24.93 
 
 		 1277 aa  55.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  26.01 
 
 		 1327 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  24.13 
 
 		 864 aa  53.9  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  24.09 
 
 		 1234 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  25.32 
 
 		 2057 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.85 
 
 		 1741 aa  51.6  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  23.97 
 
 		 989 aa  50.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  24.48 
 
 		 948 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.96 
 
 		 1009 aa  50.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  24.64 
 
 		 1593 aa  50.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  25.08 
 
 		 1093 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  26.01 
 
 		 2926 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  25.08 
 
 		 1093 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2793  outer membrane autotransporter  26.35 
 
 		 1932 aa  50.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.612871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  24.57 
 
 		 1806 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3921  outer membrane autotransporter  26.6 
 
 		 1269 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728778 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  26.79 
 
 		 1115 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  26.85 
 
 		 3506 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  28.9 
 
 		 1028 aa  47.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  22.82 
 
 		 1769 aa  47.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  27.4 
 
 		 466 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  26.69 
 
 		 950 aa  47.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>