12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2793 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2793  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1932 aa  3658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.612871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  34.1 
 
 
1144 aa  155  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.64 
 
 
1122 aa  154  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1896  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.53 
 
 
780 aa  85.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0073  outer membrane autotransporter  28.74 
 
 
943 aa  68.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.475524 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.64 
 
 
947 aa  61.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2381  hypothetical protein  32.47 
 
 
530 aa  59.3  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.782862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  27.44 
 
 
729 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  23.23 
 
 
1234 aa  51.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  28.57 
 
 
800 aa  48.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  24.43 
 
 
731 aa  48.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  24.54 
 
 
815 aa  46.2  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>