28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0073 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0073  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 943 aa  1847    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.475524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1896  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.99 
 
 		 780 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  34.06 
 
 		 645 aa  168  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  33.24 
 
 		 638 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  34 
 
 		 652 aa  158  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  25.87 
 
 		 1040 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  27.86 
 
 		 1144 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2793  outer membrane autotransporter  28.74 
 
 		 1932 aa  68.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.612871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.4 
 
 		 1122 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  30.07 
 
 		 864 aa  62  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.33 
 
 		 947 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.52 
 
 		 1446 aa  58.9  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.58 
 
 		 769 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  25.39 
 
 		 709 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  23.42 
 
 		 1108 aa  52.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 955 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  25 
 
 		 955 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 955 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  25 
 
 		 955 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  32.95 
 
 		 927 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  30.41 
 
 		 1115 aa  48.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  24.17 
 
 		 950 aa  47.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  22.91 
 
 		 731 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  28.08 
 
 		 1099 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  29.65 
 
 		 1093 aa  45.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  29.65 
 
 		 1093 aa  45.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  29.68 
 
 		 1325 aa  45.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  31.19 
 
 		 924 aa  44.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>