98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2424 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  99.79 
 
 		 955 aa  1910    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  99.79 
 
 		 955 aa  1911    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1682  hypothetical protein  95.85 
 
 		 386 aa  690    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.402738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  99.79 
 
 		 955 aa  1910    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  97.5 
 
 		 961 aa  1773    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 955 aa  1914    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  26.94 
 
 		 730 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  27.24 
 
 		 709 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  27.29 
 
 		 729 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  28.16 
 
 		 773 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  27.03 
 
 		 733 aa  135  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  27.84 
 
 		 732 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  26.68 
 
 		 769 aa  129  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  25.76 
 
 		 731 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  27.44 
 
 		 1008 aa  126  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  26.3 
 
 		 747 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  26.09 
 
 		 638 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  26.09 
 
 		 638 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  25.87 
 
 		 638 aa  115  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  24.28 
 
 		 1067 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  25.47 
 
 		 759 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  25.47 
 
 		 759 aa  99.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  25.25 
 
 		 863 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  25.25 
 
 		 836 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  25.25 
 
 		 836 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  25.25 
 
 		 863 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.25 
 
 		 836 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  25.26 
 
 		 759 aa  97.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  24.55 
 
 		 765 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  23.6 
 
 		 800 aa  93.2  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  24.23 
 
 		 863 aa  92.8  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  25.12 
 
 		 429 aa  90.9  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  24.46 
 
 		 1070 aa  90.9  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  24.21 
 
 		 1070 aa  89  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.75 
 
 		 1023 aa  87.4  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  23.26 
 
 		 815 aa  87.4  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  24.55 
 
 		 562 aa  84.7  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.48 
 
 		 868 aa  83.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.14 
 
 		 1099 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.04 
 
 		 1770 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  22.38 
 
 		 1366 aa  77.8  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  24.55 
 
 		 1117 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  24.75 
 
 		 1093 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  24.75 
 
 		 1093 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  26.44 
 
 		 955 aa  75.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  24.65 
 
 		 1602 aa  75.1  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  25.58 
 
 		 1770 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  24.09 
 
 		 1541 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  24.66 
 
 		 1441 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  24 
 
 		 1300 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  24.54 
 
 		 947 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  24.16 
 
 		 1579 aa  71.6  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  28.82 
 
 		 1971 aa  71.2  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4650  serine protease EatA  22.13 
 
 		 1285 aa  67.4  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  23.87 
 
 		 950 aa  65.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1748 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  24.53 
 
 		 773 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  24.86 
 
 		 1762 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  26.46 
 
 		 955 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  24.86 
 
 		 1762 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  23.03 
 
 		 3322 aa  63.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  25.66 
 
 		 1234 aa  62  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  24.31 
 
 		 995 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.06 
 
 		 1115 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  24.9 
 
 		 1763 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  25.26 
 
 		 819 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.61 
 
 		 1009 aa  58.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  27.03 
 
 		 1593 aa  57.4  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.81 
 
 		 1357 aa  56.6  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3921  outer membrane autotransporter  25.86 
 
 		 1269 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728778 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  24.48 
 
 		 1040 aa  56.2  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  24.24 
 
 		 1741 aa  55.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.11 
 
 		 1055 aa  55.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  22.78 
 
 		 2057 aa  54.7  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  23.61 
 
 		 818 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  24.42 
 
 		 1571 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  22.6 
 
 		 1113 aa  52.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  21.76 
 
 		 909 aa  52.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  24.84 
 
 		 825 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  23.03 
 
 		 1004 aa  52.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1165 aa  52  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1165 aa  52  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0073  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 943 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.475524 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  22.84 
 
 		 820 aa  50.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  24.32 
 
 		 1861 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  24.93 
 
 		 2578 aa  49.7  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  24.93 
 
 		 2906 aa  49.7  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  53.85 
 
 		 1281 aa  48.9  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  55.26 
 
 		 268 aa  48.9  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  27.22 
 
 		 236 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  21.41 
 
 		 997 aa  48.5  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  22.82 
 
 		 924 aa  47.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.89 
 
 		 1197 aa  47  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  22.7 
 
 		 1806 aa  45.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  22.7 
 
 		 1327 aa  45.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  24.14 
 
 		 1108 aa  45.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  21.24 
 
 		 927 aa  45.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 202 aa  44.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>