25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1896 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1896  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 780 aa  1496    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0073  outer membrane autotransporter  45.99 
 
 		 943 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.475524 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  37.43 
 
 		 652 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  35.08 
 
 		 638 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  34.3 
 
 		 645 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.47 
 
 		 1122 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  28.82 
 
 		 1144 aa  94  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2793  outer membrane autotransporter  30.53 
 
 		 1932 aa  85.1  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.612871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  23.89 
 
 		 1040 aa  70.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  25.6 
 
 		 947 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  25.19 
 
 		 1099 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  26.01 
 
 		 1115 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  27.07 
 
 		 864 aa  57  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  24.25 
 
 		 731 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  23.34 
 
 		 1008 aa  50.8  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  27.82 
 
 		 1093 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  21.78 
 
 		 909 aa  49.3  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  27.82 
 
 		 1093 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  26.47 
 
 		 927 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.31 
 
 		 1741 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  24.77 
 
 		 1234 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  32.18 
 
 		 1277 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  24.22 
 
 		 1593 aa  44.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  21.67 
 
 		 1067 aa  44.3  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  28.44 
 
 		 924 aa  44.3  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>