141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3770 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  72.6 
 
 		 1277 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 1234 aa  2449    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  34.81 
 
 		 1579 aa  309  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  34.51 
 
 		 1594 aa  309  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.68 
 
 		 868 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  29 
 
 		 773 aa  280  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  34.53 
 
 		 2637 aa  263  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  34.88 
 
 		 4312 aa  262  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  34.67 
 
 		 4391 aa  261  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  34.69 
 
 		 1806 aa  260  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  33.93 
 
 		 989 aa  259  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  34.98 
 
 		 1327 aa  253  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  34.98 
 
 		 466 aa  239  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  33.74 
 
 		 2057 aa  238  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  33.53 
 
 		 1349 aa  234  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  30.95 
 
 		 1040 aa  235  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  33.53 
 
 		 1327 aa  234  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 1327 aa  232  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  30.31 
 
 		 1028 aa  229  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  31.79 
 
 		 995 aa  228  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  31.27 
 
 		 1748 aa  221  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  32.18 
 
 		 1763 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  30.36 
 
 		 1762 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  30.36 
 
 		 1762 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.83 
 
 		 806 aa  218  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  30.28 
 
 		 1102 aa  206  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  30.95 
 
 		 1753 aa  206  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  31.13 
 
 		 1770 aa  205  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  32.9 
 
 		 1165 aa  204  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  32.9 
 
 		 1165 aa  204  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  28.47 
 
 		 947 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  30.63 
 
 		 1770 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  33.91 
 
 		 955 aa  200  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  33.62 
 
 		 955 aa  198  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  31.87 
 
 		 3322 aa  195  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.96 
 
 		 1086 aa  185  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  32.82 
 
 		 338 aa  173  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  32.36 
 
 		 306 aa  160  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  38.24 
 
 		 1626 aa  159  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  29.11 
 
 		 1099 aa  151  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  29.51 
 
 		 818 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.15 
 
 		 1234 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  28.15 
 
 		 1234 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  28.33 
 
 		 1250 aa  142  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  28.21 
 
 		 1234 aa  141  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  30.26 
 
 		 819 aa  141  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  30.26 
 
 		 825 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  28.1 
 
 		 1254 aa  139  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  29.12 
 
 		 1093 aa  139  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  29.12 
 
 		 1093 aa  139  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  28.44 
 
 		 1250 aa  137  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.13 
 
 		 1067 aa  136  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  26.59 
 
 		 1004 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  48.21 
 
 		 1049 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  27.65 
 
 		 1252 aa  134  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  25.98 
 
 		 997 aa  131  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  30.83 
 
 		 2906 aa  125  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  31.34 
 
 		 2578 aa  125  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  31.15 
 
 		 1108 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  27.89 
 
 		 1115 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  30.27 
 
 		 1113 aa  122  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  31.34 
 
 		 1861 aa  122  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  24.95 
 
 		 1070 aa  122  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  29.04 
 
 		 924 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  25.05 
 
 		 1070 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.29 
 
 		 1023 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  29.7 
 
 		 950 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  29.84 
 
 		 2926 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  27.1 
 
 		 1741 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  29.16 
 
 		 3420 aa  109  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  28.51 
 
 		 1571 aa  108  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  29.67 
 
 		 3415 aa  108  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  24.66 
 
 		 1602 aa  108  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  29.01 
 
 		 1593 aa  106  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5168  hypothetical protein  68.75 
 
 		 79 aa  104  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.32759  normal  0.551734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  26.34 
 
 		 773 aa  99  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  26.85 
 
 		 730 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  26.99 
 
 		 1012 aa  92.8  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  53.1 
 
 		 909 aa  91.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.17 
 
 		 1357 aa  91.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2848  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  90.1  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.5 
 
 		 1009 aa  89.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  28.42 
 
 		 1259 aa  89  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  28.22 
 
 		 1268 aa  89  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  27.92 
 
 		 1269 aa  88.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.2 
 
 		 769 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  28.42 
 
 		 1259 aa  87.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  28.42 
 
 		 1285 aa  86.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  25.64 
 
 		 506 aa  84.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  27.15 
 
 		 1068 aa  84  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  25.64 
 
 		 506 aa  84  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  27.8 
 
 		 1254 aa  83.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.55 
 
 		 1039 aa  81.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  24.23 
 
 		 1008 aa  80.9  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  25.73 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  24.23 
 
 		 709 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  33.01 
 
 		 914 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  24.71 
 
 		 733 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  29.81 
 
 		 927 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.9 
 
 		 1055 aa  75.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>