207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4307 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  86.67 
 
 		 1115 aa  1692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  85.33 
 
 		 1093 aa  1709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  85.33 
 
 		 1093 aa  1709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1099 aa  2110    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  40.5 
 
 		 924 aa  392  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  41.89 
 
 		 909 aa  376  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  40.69 
 
 		 818 aa  357  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  40.19 
 
 		 819 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  40.19 
 
 		 825 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  36.61 
 
 		 1040 aa  304  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.79 
 
 		 1009 aa  303  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  34.66 
 
 		 1741 aa  271  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.53 
 
 		 1357 aa  240  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  31.27 
 
 		 1770 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  31.22 
 
 		 1762 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  31.22 
 
 		 1762 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  32.52 
 
 		 1049 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  35.36 
 
 		 1770 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  30.71 
 
 		 1763 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  34.58 
 
 		 1748 aa  229  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  34.77 
 
 		 1753 aa  228  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  32.19 
 
 		 947 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.69 
 
 		 1055 aa  220  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  36 
 
 		 914 aa  211  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  35.08 
 
 		 864 aa  202  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  34.48 
 
 		 927 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.83 
 
 		 950 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  30.53 
 
 		 1108 aa  186  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  31.66 
 
 		 3420 aa  177  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  31.98 
 
 		 3415 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.94 
 
 		 3322 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  30 
 
 		 1113 aa  170  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  32.13 
 
 		 2057 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  30.98 
 
 		 1067 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  30.57 
 
 		 1571 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  32.9 
 
 		 989 aa  167  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.57 
 
 		 1023 aa  161  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  31.79 
 
 		 1593 aa  160  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  31.25 
 
 		 1070 aa  158  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  31.04 
 
 		 1070 aa  155  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  34.53 
 
 		 861 aa  155  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  30.27 
 
 		 2637 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  28.79 
 
 		 2926 aa  152  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  28.23 
 
 		 1806 aa  151  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  28.72 
 
 		 1594 aa  143  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  29.09 
 
 		 2906 aa  141  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  32.64 
 
 		 1626 aa  135  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  28.47 
 
 		 2578 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.13 
 
 		 1039 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  28.18 
 
 		 1861 aa  129  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  28.12 
 
 		 1234 aa  128  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  27.63 
 
 		 1068 aa  128  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  27.03 
 
 		 1327 aa  127  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  28.27 
 
 		 1268 aa  124  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  28.62 
 
 		 1259 aa  124  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  28.16 
 
 		 1254 aa  123  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  26.53 
 
 		 1579 aa  123  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  28.12 
 
 		 1269 aa  122  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  27.68 
 
 		 1349 aa  122  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  28.88 
 
 		 356 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  26.86 
 
 		 4312 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  26.69 
 
 		 4391 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  27.54 
 
 		 1327 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1165 aa  119  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1165 aa  119  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  28.3 
 
 		 1012 aa  117  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  27.49 
 
 		 1327 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  28.79 
 
 		 1259 aa  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  28.79 
 
 		 1285 aa  116  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  30.81 
 
 		 948 aa  114  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  26.95 
 
 		 466 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  28.4 
 
 		 358 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  30.81 
 
 		 949 aa  112  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  28.67 
 
 		 948 aa  110  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.71 
 
 		 1197 aa  109  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  32.13 
 
 		 358 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  26.35 
 
 		 358 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  30.52 
 
 		 389 aa  108  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.25 
 
 		 868 aa  108  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  28.48 
 
 		 820 aa  107  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  32.31 
 
 		 1508 aa  102  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  29.34 
 
 		 948 aa  97.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  38.11 
 
 		 2003 aa  96.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  26.65 
 
 		 1277 aa  95.9  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  24.9 
 
 		 1602 aa  93.6  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  45.76 
 
 		 995 aa  92.8  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  33.92 
 
 		 2396 aa  91.3  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  33.62 
 
 		 994 aa  90.1  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  40.44 
 
 		 1172 aa  89.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  44.24 
 
 		 1971 aa  89.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.26 
 
 		 3629 aa  89  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.26 
 
 		 806 aa  88.6  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.99 
 
 		 1227 aa  89  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  26.09 
 
 		 1102 aa  88.2  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  39 
 
 		 3391 aa  88.2  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  26.72 
 
 		 773 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  31.95 
 
 		 2711 aa  84  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  32.83 
 
 		 2365 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  33.76 
 
 		 1550 aa  82.8  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  45.45 
 
 		 1028 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>