48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2537 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  100 
 
 		 356 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  43.96 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  43.8 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  44.51 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  42.78 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  39.08 
 
 		 914 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  35.38 
 
 		 927 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  32.01 
 
 		 819 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  32.32 
 
 		 818 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  31.4 
 
 		 825 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  29.57 
 
 		 909 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  27.13 
 
 		 864 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  29.1 
 
 		 1115 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  28.88 
 
 		 1093 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  28.88 
 
 		 1093 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  28.88 
 
 		 1099 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.36 
 
 		 1009 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  35.44 
 
 		 1049 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  30.3 
 
 		 1040 aa  99.4  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  25.78 
 
 		 924 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.7 
 
 		 1741 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.87 
 
 		 1055 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  24.44 
 
 		 947 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.09 
 
 		 820 aa  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  27.62 
 
 		 759 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  26.78 
 
 		 759 aa  62.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  27.07 
 
 		 759 aa  62.8  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  29.49 
 
 		 1070 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  29.3 
 
 		 1067 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  29.49 
 
 		 1070 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.45 
 
 		 1357 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  26.79 
 
 		 1763 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 		 1770 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  26.79 
 
 		 1762 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  26.79 
 
 		 1762 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.12 
 
 		 729 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.79 
 
 		 1753 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  22.45 
 
 		 638 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  22.45 
 
 		 638 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  22.45 
 
 		 638 aa  53.1  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.79 
 
 		 1770 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  26.03 
 
 		 1748 aa  49.7  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  25.95 
 
 		 731 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  26.09 
 
 		 730 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1133  outer membrane autotransporter  25.23 
 
 		 1058 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1132  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 		 825 aa  44.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  30.83 
 
 		 989 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  26.32 
 
 		 765 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>