151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3370 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1068 aa  2088    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  50.08 
 
 
2926 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  48.06 
 
 
3415 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  48.06 
 
 
3420 aa  509  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  44.01 
 
 
1571 aa  479  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  47.56 
 
 
1012 aa  445  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  43.45 
 
 
950 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  38.86 
 
 
1108 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  39.08 
 
 
1593 aa  365  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  33.96 
 
 
1113 aa  332  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  37.02 
 
 
2578 aa  326  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  37.19 
 
 
2906 aa  325  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  34.05 
 
 
1259 aa  324  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  37.19 
 
 
1861 aa  323  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  33.69 
 
 
1268 aa  322  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  33.69 
 
 
1269 aa  321  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  34.05 
 
 
1285 aa  321  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  33.91 
 
 
1259 aa  321  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  33.69 
 
 
1254 aa  320  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  34.39 
 
 
861 aa  188  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  32.36 
 
 
4391 aa  162  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  31.73 
 
 
4312 aa  158  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.86 
 
 
1099 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.92 
 
 
1023 aa  125  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  28.76 
 
 
1093 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  28.76 
 
 
1093 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  25.55 
 
 
989 aa  120  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  27.76 
 
 
1115 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.86 
 
 
2363 aa  115  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  52.38 
 
 
1086 aa  115  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  29.09 
 
 
1741 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  27.15 
 
 
1040 aa  112  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  28.27 
 
 
1753 aa  111  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  28.4 
 
 
1763 aa  111  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.64 
 
 
1762 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.64 
 
 
1762 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  27.24 
 
 
1806 aa  110  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  27.44 
 
 
1770 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  27.44 
 
 
1770 aa  106  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.57 
 
 
947 aa  104  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  27.21 
 
 
773 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.3 
 
 
1357 aa  103  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.64 
 
 
1327 aa  100  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  27.37 
 
 
1748 aa  98.2  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  28.57 
 
 
466 aa  98.2  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  25.85 
 
 
1327 aa  95.9  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  25.85 
 
 
1327 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  25.84 
 
 
2637 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  33.87 
 
 
1626 aa  94.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.27 
 
 
1067 aa  94.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  26.89 
 
 
1594 aa  94.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 
1070 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  26.64 
 
 
1070 aa  92.8  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  23.63 
 
 
1579 aa  92.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  39.2 
 
 
1119 aa  92  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  43.06 
 
 
1172 aa  92  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  24.63 
 
 
825 aa  91.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  26.94 
 
 
1165 aa  91.3  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  26.94 
 
 
1165 aa  91.3  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.41 
 
 
1227 aa  84  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  27.78 
 
 
1277 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  44.64 
 
 
3322 aa  82.8  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  48.76 
 
 
2057 aa  82.8  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.5 
 
 
1055 aa  82.4  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  40.35 
 
 
987 aa  82  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  44.35 
 
 
955 aa  81.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  23.19 
 
 
819 aa  82  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  44.35 
 
 
955 aa  81.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.35 
 
 
806 aa  80.5  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.16 
 
 
1011 aa  80.9  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  27.79 
 
 
1234 aa  80.1  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  29.86 
 
 
1004 aa  80.1  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  29.86 
 
 
997 aa  80.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  35.2 
 
 
1881 aa  79.7  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  38.37 
 
 
914 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.67 
 
 
1322 aa  77.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  38.05 
 
 
864 aa  77  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.9 
 
 
868 aa  75.5  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  33.87 
 
 
1252 aa  75.1  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  40.62 
 
 
1234 aa  74.7  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.62 
 
 
1234 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  40.62 
 
 
1234 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  30.28 
 
 
1254 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  40.62 
 
 
1250 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  41.23 
 
 
927 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.36 
 
 
1029 aa  72.8  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  36 
 
 
1550 aa  71.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  34.4 
 
 
1519 aa  71.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.61 
 
 
1009 aa  70.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  31.88 
 
 
818 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  43.57 
 
 
2003 aa  68.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  38.28 
 
 
1250 aa  68.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  22.29 
 
 
924 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  24.65 
 
 
909 aa  66.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  56.06 
 
 
506 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  56.06 
 
 
506 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  35.22 
 
 
1459 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  34.91 
 
 
882 aa  64.3  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  34.02 
 
 
1782 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  38.89 
 
 
995 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>