116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1662 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2123  putative lipoprotein  97.59 
 
 		 1297 aa  2400    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.590284  normal  0.395646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  96.61 
 
 		 1327 aa  1560    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  97.59 
 
 		 1806 aa  3066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  100 
 
 		 1626 aa  3222    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  93.03 
 
 		 466 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  40.56 
 
 		 2637 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  38.29 
 
 		 4391 aa  476  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  38.05 
 
 		 4312 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  37.22 
 
 		 1165 aa  316  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  37.22 
 
 		 1165 aa  316  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  58.46 
 
 		 1579 aa  309  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  56.07 
 
 		 1594 aa  305  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  42.19 
 
 		 1349 aa  293  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  42.19 
 
 		 1327 aa  292  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  42.19 
 
 		 1327 aa  291  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  49.3 
 
 		 868 aa  260  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  48.11 
 
 		 773 aa  231  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  54.49 
 
 		 955 aa  176  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  32.64 
 
 		 1102 aa  176  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  53.85 
 
 		 955 aa  174  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.49 
 
 		 3322 aa  170  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  30.58 
 
 		 1113 aa  166  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  34.94 
 
 		 989 aa  166  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  31.92 
 
 		 2906 aa  158  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  31.92 
 
 		 2578 aa  157  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  31.92 
 
 		 1861 aa  154  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.18 
 
 		 2057 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.91 
 
 		 806 aa  150  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  32.72 
 
 		 861 aa  145  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  33.77 
 
 		 1108 aa  146  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  52.17 
 
 		 338 aa  144  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  35.66 
 
 		 1234 aa  142  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  33.66 
 
 		 1277 aa  140  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  32.38 
 
 		 1099 aa  132  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  31.1 
 
 		 2926 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  29.38 
 
 		 950 aa  124  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.04 
 
 		 1023 aa  122  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  40.61 
 
 		 1004 aa  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  32.57 
 
 		 1234 aa  117  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  29.43 
 
 		 1093 aa  116  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  29.43 
 
 		 1093 aa  116  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.9 
 
 		 1234 aa  115  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  32.9 
 
 		 1250 aa  115  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  30.63 
 
 		 3420 aa  114  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  30.98 
 
 		 1234 aa  114  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  39.39 
 
 		 997 aa  112  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  30.38 
 
 		 3415 aa  111  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  31.82 
 
 		 1252 aa  111  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  30.9 
 
 		 1115 aa  110  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  47.75 
 
 		 306 aa  109  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  31.07 
 
 		 1254 aa  108  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  31.37 
 
 		 1250 aa  105  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  29.58 
 
 		 1741 aa  103  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  30.73 
 
 		 1012 aa  102  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  28.37 
 
 		 1571 aa  102  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  31.19 
 
 		 860 aa  100  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  37.55 
 
 		 1593 aa  95.1  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  33.87 
 
 		 1068 aa  95.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  33.21 
 
 		 1748 aa  94  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  35.35 
 
 		 1067 aa  91.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  31.16 
 
 		 1259 aa  88.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  31.39 
 
 		 1762 aa  88.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  31.39 
 
 		 1762 aa  88.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  30.91 
 
 		 1763 aa  88.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  30.75 
 
 		 1268 aa  87.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  30.36 
 
 		 1259 aa  87  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  32.25 
 
 		 1753 aa  85.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  30.36 
 
 		 1254 aa  85.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  31.27 
 
 		 1770 aa  85.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  31.89 
 
 		 947 aa  84.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  31.14 
 
 		 1770 aa  84.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.23 
 
 		 972 aa  84.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.4 
 
 		 1086 aa  85.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  30.24 
 
 		 1285 aa  84.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  27.56 
 
 		 825 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  27.33 
 
 		 818 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  30.64 
 
 		 1459 aa  79.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  34.42 
 
 		 1070 aa  79  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  35.43 
 
 		 927 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.67 
 
 		 1357 aa  78.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  34.42 
 
 		 1070 aa  78.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  27.24 
 
 		 819 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  30.15 
 
 		 995 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  36.6 
 
 		 914 aa  75.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  31.37 
 
 		 1040 aa  75.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.18 
 
 		 1055 aa  74.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  53.52 
 
 		 506 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  26.71 
 
 		 924 aa  70.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  53.52 
 
 		 506 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  28.7 
 
 		 1458 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  29.71 
 
 		 909 aa  61.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.07 
 
 		 1029 aa  61.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  31.65 
 
 		 2003 aa  60.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.2 
 
 		 1322 aa  59.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.93 
 
 		 1694 aa  59.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  27.71 
 
 		 733 aa  58.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  26.32 
 
 		 769 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  34.48 
 
 		 1049 aa  58.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  31.52 
 
 		 1333 aa  58.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  24.07 
 
 		 709 aa  56.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>