107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1247 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  100 
 
 		 820 aa  1660    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  34.66 
 
 		 1762 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  34.66 
 
 		 1762 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  32.93 
 
 		 1770 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  32.93 
 
 		 1770 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  34.36 
 
 		 1763 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  28.99 
 
 		 1748 aa  180  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  34.36 
 
 		 1753 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.04 
 
 		 1023 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  32.41 
 
 		 1070 aa  147  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  32.41 
 
 		 1067 aa  147  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  32.41 
 
 		 1070 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  26.13 
 
 		 1040 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  26.36 
 
 		 909 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  28.17 
 
 		 1115 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  29.86 
 
 		 2578 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  27.55 
 
 		 1093 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  27.55 
 
 		 1093 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  25.3 
 
 		 864 aa  108  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  28.48 
 
 		 1099 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  29.59 
 
 		 1861 aa  107  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  30.08 
 
 		 2906 aa  106  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  28.92 
 
 		 950 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  26.56 
 
 		 914 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  27.47 
 
 		 1113 aa  103  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  30.21 
 
 		 1012 aa  102  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  25.45 
 
 		 927 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  27.79 
 
 		 1108 aa  99  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  26.89 
 
 		 1593 aa  97.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.83 
 
 		 818 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  29.69 
 
 		 819 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  29.69 
 
 		 825 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  24.34 
 
 		 947 aa  90.1  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  26.91 
 
 		 1806 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  27.39 
 
 		 3415 aa  89  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  26.99 
 
 		 924 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  26.93 
 
 		 1327 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  26.74 
 
 		 3420 aa  85.9  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  28.17 
 
 		 1327 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  26.93 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  28.32 
 
 		 1349 aa  84.7  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1165 aa  84.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1165 aa  84.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  24.31 
 
 		 1277 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  27.98 
 
 		 1327 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  26.93 
 
 		 773 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  25 
 
 		 1049 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  26.09 
 
 		 1268 aa  82.4  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.32 
 
 		 1009 aa  81.6  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  26.09 
 
 		 1259 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 		 1571 aa  80.1  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  26.01 
 
 		 1269 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  25.96 
 
 		 1259 aa  79.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  26.17 
 
 		 1285 aa  79  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  26.17 
 
 		 1254 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  24.7 
 
 		 1594 aa  75.1  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  25.52 
 
 		 955 aa  72.4  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  26.05 
 
 		 955 aa  71.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  29.18 
 
 		 3322 aa  71.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.1 
 
 		 2057 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.86 
 
 		 868 aa  69.3  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.9 
 
 		 806 aa  68.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  24.9 
 
 		 2637 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  25.67 
 
 		 1234 aa  67.8  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.76 
 
 		 729 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  24.37 
 
 		 730 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  26.09 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  25.4 
 
 		 2926 aa  65.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  24.71 
 
 		 1741 aa  65.1  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  22.7 
 
 		 389 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  24.47 
 
 		 989 aa  63.9  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  23.59 
 
 		 1579 aa  63.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  22.38 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  23.31 
 
 		 1602 aa  61.2  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.65 
 
 		 1357 aa  60.8  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1132  outer membrane autotransporter  24.75 
 
 		 825 aa  59.7  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  22.81 
 
 		 773 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  25.09 
 
 		 1004 aa  58.9  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  23.43 
 
 		 732 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  24.84 
 
 		 1008 aa  56.6  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  23.97 
 
 		 997 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  29.81 
 
 		 1626 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  22.36 
 
 		 358 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  24.6 
 
 		 759 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.05 
 
 		 1055 aa  52.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  23.12 
 
 		 358 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  24.6 
 
 		 759 aa  52  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  24.6 
 
 		 759 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  22.88 
 
 		 733 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  24.42 
 
 		 1971 aa  51.6  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  24.27 
 
 		 948 aa  51.6  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  22.96 
 
 		 1068 aa  51.2  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.05 
 
 		 1039 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  25.06 
 
 		 4391 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  22.43 
 
 		 948 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  23.6 
 
 		 948 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  23.89 
 
 		 338 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.62 
 
 		 1122 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3921  outer membrane autotransporter  28.02 
 
 		 1269 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728778 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  27.88 
 
 		 1366 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>