179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2844 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1357 aa  2566    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  62.8 
 
 		 1741 aa  835    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  62.35 
 
 		 1055 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  38.41 
 
 		 950 aa  272  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  35.19 
 
 		 1099 aa  268  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  34.24 
 
 		 1093 aa  254  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  34.24 
 
 		 1093 aa  254  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  33.66 
 
 		 1115 aa  232  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  35.37 
 
 		 1040 aa  217  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  32.59 
 
 		 818 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  33.53 
 
 		 825 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 819 aa  194  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  33.66 
 
 		 1571 aa  183  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  35.06 
 
 		 1113 aa  181  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  33.68 
 
 		 2906 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  33.14 
 
 		 909 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  34.09 
 
 		 2578 aa  165  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  34.36 
 
 		 1861 aa  163  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  30.45 
 
 		 1108 aa  162  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  40.05 
 
 		 861 aa  160  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.3 
 
 		 1009 aa  156  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  31.95 
 
 		 1748 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  32.58 
 
 		 927 aa  152  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  31.97 
 
 		 1753 aa  152  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  31.95 
 
 		 3420 aa  149  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  33.78 
 
 		 2926 aa  149  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  32.16 
 
 		 1762 aa  149  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  32.16 
 
 		 1762 aa  149  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  31.98 
 
 		 1763 aa  148  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  30.86 
 
 		 1593 aa  147  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  31.8 
 
 		 3415 aa  146  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  31.04 
 
 		 924 aa  140  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  31.05 
 
 		 1770 aa  138  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  30.87 
 
 		 1770 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  30.87 
 
 		 947 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.23 
 
 		 2057 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  47.15 
 
 		 1971 aa  131  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  29.6 
 
 		 914 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  27.51 
 
 		 1806 aa  121  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  31.88 
 
 		 989 aa  119  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  46.19 
 
 		 2363 aa  119  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1165 aa  113  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1165 aa  113  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  31.4 
 
 		 1277 aa  112  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 		 1068 aa  112  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  30 
 
 		 773 aa  112  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  31.05 
 
 		 1626 aa  112  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  26.66 
 
 		 1327 aa  111  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  29.86 
 
 		 1049 aa  108  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  28.73 
 
 		 2637 aa  108  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  36.29 
 
 		 3322 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  29.54 
 
 		 1594 aa  107  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.16 
 
 		 1023 aa  106  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  28.4 
 
 		 1102 aa  103  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  29.87 
 
 		 1067 aa  102  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  28.23 
 
 		 466 aa  99.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  34.85 
 
 		 3506 aa  95.1  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  28.06 
 
 		 1012 aa  94.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44 
 
 		 1285 aa  93.6  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  28.73 
 
 		 1579 aa  92  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  29.11 
 
 		 1070 aa  91.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  28.8 
 
 		 1259 aa  91.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  30.77 
 
 		 1234 aa  89.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  28.83 
 
 		 1254 aa  89.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  36.09 
 
 		 2642 aa  89.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  40.22 
 
 		 1078 aa  89  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.59 
 
 		 868 aa  88.6  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  28.61 
 
 		 1070 aa  88.2  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  26.83 
 
 		 4391 aa  88.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  30.13 
 
 		 1259 aa  87.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  29.44 
 
 		 1285 aa  87  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  29.58 
 
 		 1268 aa  86.3  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  30.13 
 
 		 1269 aa  86.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  27.03 
 
 		 4312 aa  85.5  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  28.14 
 
 		 995 aa  85.1  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1881 aa  84.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  42.77 
 
 		 1550 aa  82.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1530 aa  80.9  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  35.83 
 
 		 1180 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  29.12 
 
 		 948 aa  80.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  26.85 
 
 		 1327 aa  80.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  26.85 
 
 		 1327 aa  80.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  26.85 
 
 		 1349 aa  78.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.76 
 
 		 1848 aa  77.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  39.11 
 
 		 1111 aa  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  26.74 
 
 		 1234 aa  77.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  32.1 
 
 		 1250 aa  77.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  34.88 
 
 		 1130 aa  77.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  35.23 
 
 		 1172 aa  77.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.1 
 
 		 1234 aa  76.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.86 
 
 		 1227 aa  75.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  44.6 
 
 		 2407 aa  74.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  29.42 
 
 		 948 aa  73.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  29.68 
 
 		 948 aa  73.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  41.79 
 
 		 994 aa  72.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  28.01 
 
 		 1008 aa  72.4  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  31.69 
 
 		 1252 aa  72.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.18 
 
 		 3629 aa  72  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  45.38 
 
 		 1234 aa  72  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.85 
 
 		 1039 aa  71.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>