183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5838 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1227 aa  2382    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  39.68 
 
 		 1119 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  41.72 
 
 		 1519 aa  452  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.45 
 
 		 919 aa  446  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  39.4 
 
 		 1508 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  38.28 
 
 		 1550 aa  442  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  38.86 
 
 		 2396 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  41.25 
 
 		 2365 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  41.13 
 
 		 2346 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  37.95 
 
 		 2003 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  39.08 
 
 		 2366 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  39.58 
 
 		 2371 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.02 
 
 		 1029 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.2 
 
 		 1285 aa  379  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  38.09 
 
 		 650 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  38.32 
 
 		 3822 aa  363  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  38.21 
 
 		 4238 aa  363  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  38.09 
 
 		 4238 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  38.17 
 
 		 3954 aa  361  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.73 
 
 		 972 aa  358  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  36.91 
 
 		 3506 aa  356  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.99 
 
 		 1848 aa  354  5.9999999999999994e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  38.96 
 
 		 995 aa  346  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  38.17 
 
 		 986 aa  337  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1881 aa  327  7e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  36.27 
 
 		 1782 aa  315  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  34.63 
 
 		 677 aa  302  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.12 
 
 		 1011 aa  291  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  37.37 
 
 		 1004 aa  286  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  35.22 
 
 		 991 aa  280  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  36.01 
 
 		 1333 aa  277  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  36.14 
 
 		 1033 aa  276  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  35.4 
 
 		 995 aa  273  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  36.63 
 
 		 1001 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  36.4 
 
 		 1001 aa  268  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  32.37 
 
 		 1056 aa  267  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  36.28 
 
 		 1055 aa  265  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  33.16 
 
 		 1164 aa  262  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  36.09 
 
 		 1028 aa  258  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  38.06 
 
 		 1053 aa  255  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  35.49 
 
 		 1038 aa  254  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  34.14 
 
 		 990 aa  251  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  33.69 
 
 		 983 aa  248  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  36.99 
 
 		 1062 aa  248  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  32.22 
 
 		 2711 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.64 
 
 		 1125 aa  243  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  32.64 
 
 		 1130 aa  241  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  32.22 
 
 		 1129 aa  238  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  32.22 
 
 		 1131 aa  238  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  32.07 
 
 		 1129 aa  236  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  32.07 
 
 		 1131 aa  236  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  32.07 
 
 		 1131 aa  236  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  32.07 
 
 		 1131 aa  236  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  33.07 
 
 		 1006 aa  234  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  35.34 
 
 		 1131 aa  231  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  29.89 
 
 		 1011 aa  219  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  32.87 
 
 		 1152 aa  214  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  36.84 
 
 		 1016 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  33.06 
 
 		 1459 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  39.62 
 
 		 2926 aa  210  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  33.87 
 
 		 1458 aa  205  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  32.01 
 
 		 980 aa  192  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  42.04 
 
 		 2906 aa  191  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.6 
 
 		 1081 aa  182  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  30.43 
 
 		 985 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  32.14 
 
 		 994 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  42.91 
 
 		 2578 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  37.47 
 
 		 1113 aa  159  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  44.69 
 
 		 2363 aa  154  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  29.58 
 
 		 1111 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  29.68 
 
 		 1180 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  30.79 
 
 		 407 aa  148  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  28.75 
 
 		 2407 aa  147  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  39.12 
 
 		 1593 aa  142  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.08 
 
 		 1532 aa  137  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  35.79 
 
 		 1130 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.65 
 
 		 1489 aa  131  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  29.19 
 
 		 1769 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  30.81 
 
 		 994 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  33.59 
 
 		 488 aa  128  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.93 
 
 		 1322 aa  125  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  47.31 
 
 		 1172 aa  124  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  29.14 
 
 		 816 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  41.28 
 
 		 1530 aa  122  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.83 
 
 		 3629 aa  117  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  26.44 
 
 		 1019 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  37.46 
 
 		 1571 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  37.75 
 
 		 1882 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  35.11 
 
 		 3391 aa  108  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  26.78 
 
 		 1078 aa  108  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  28.63 
 
 		 950 aa  106  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  29.43 
 
 		 882 aa  104  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  35.54 
 
 		 1741 aa  101  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.11 
 
 		 774 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  52.82 
 
 		 861 aa  98.6  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  25.68 
 
 		 814 aa  98.2  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.42 
 
 		 1066 aa  97.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.19 
 
 		 1177 aa  95.9  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  28.83 
 
 		 311 aa  94  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  37.04 
 
 		 3420 aa  91.7  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>