123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0374 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  98.19 
 
 
1349 aa  2633    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  100 
 
 
1327 aa  2680    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  99.7 
 
 
1327 aa  2672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  58.32 
 
 
1594 aa  615  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  43.05 
 
 
1165 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  43.05 
 
 
1165 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  47.8 
 
 
1806 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  57.45 
 
 
1579 aa  568  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  50.35 
 
 
2637 aa  557  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  54.05 
 
 
1327 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  54.93 
 
 
466 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  48.99 
 
 
4391 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  48.99 
 
 
4312 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  52.34 
 
 
773 aa  492  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.04 
 
 
868 aa  459  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  53.31 
 
 
955 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  42.47 
 
 
1102 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  52.91 
 
 
338 aa  350  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  38.84 
 
 
989 aa  340  8e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  52.79 
 
 
306 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  44.34 
 
 
1626 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  39.12 
 
 
1004 aa  288  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  40.74 
 
 
997 aa  280  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  34.75 
 
 
2057 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.87 
 
 
806 aa  263  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.07 
 
 
3322 aa  263  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  30.88 
 
 
1277 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  33.82 
 
 
1234 aa  221  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.35 
 
 
1234 aa  196  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  31.35 
 
 
1250 aa  196  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  31.35 
 
 
1234 aa  196  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  31.06 
 
 
1234 aa  195  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  31.49 
 
 
1252 aa  193  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  30.38 
 
 
1250 aa  188  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2123  putative lipoprotein  35.58 
 
 
1297 aa  186  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.590284  normal  0.395646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  30.82 
 
 
1108 aa  181  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  30.78 
 
 
1254 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  31.09 
 
 
2906 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  31.82 
 
 
2578 aa  175  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  31.82 
 
 
1861 aa  174  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  31.46 
 
 
995 aa  171  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  31.5 
 
 
1113 aa  168  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.26 
 
 
950 aa  166  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  29.89 
 
 
3415 aa  158  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  29.73 
 
 
3420 aa  156  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  28.65 
 
 
825 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  27.81 
 
 
819 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  31.76 
 
 
1259 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  27.43 
 
 
818 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  30.9 
 
 
1285 aa  140  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  30.11 
 
 
1269 aa  140  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  30.08 
 
 
1268 aa  139  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  31.38 
 
 
1254 aa  139  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  32.08 
 
 
1259 aa  136  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  28.51 
 
 
2926 aa  135  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  27.3 
 
 
1099 aa  126  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  29.29 
 
 
947 aa  126  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  29.34 
 
 
1028 aa  126  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  28.79 
 
 
1012 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  28.15 
 
 
1593 aa  122  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  34.39 
 
 
861 aa  120  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  26.87 
 
 
1040 aa  119  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.6 
 
 
1023 aa  116  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  26.74 
 
 
1571 aa  112  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.89 
 
 
1086 aa  104  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  25.96 
 
 
1093 aa  103  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  25.96 
 
 
1093 aa  103  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  27.84 
 
 
1763 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  27.36 
 
 
1762 aa  97.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  26.04 
 
 
1068 aa  97.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  27.36 
 
 
1762 aa  97.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  27.24 
 
 
1753 aa  96.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  26.51 
 
 
909 aa  95.1  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  27.04 
 
 
1748 aa  92.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.75 
 
 
1067 aa  92.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.93 
 
 
1115 aa  91.7  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  28.81 
 
 
820 aa  88.2  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  67.65 
 
 
506 aa  87.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  67.65 
 
 
506 aa  87.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  27.73 
 
 
1770 aa  86.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  25.6 
 
 
1741 aa  83.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22 
 
 
870 aa  83.2  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  25.25 
 
 
924 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  27.29 
 
 
1770 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1220  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.52 
 
 
863 aa  79.7  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.84 
 
 
854 aa  79.3  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  25.04 
 
 
773 aa  79  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.48 
 
 
1357 aa  78.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  25.7 
 
 
1070 aa  77.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  22.82 
 
 
914 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  26.12 
 
 
1070 aa  75.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  34.81 
 
 
927 aa  72.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  25.42 
 
 
729 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 
731 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  28.95 
 
 
730 aa  65.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  36.3 
 
 
1049 aa  65.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.7 
 
 
769 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.49 
 
 
1197 aa  62.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  26.75 
 
 
733 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.33 
 
 
1009 aa  58.9  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>