91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1267 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  99.6 
 
 		 506 aa  987    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  992    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  43.3 
 
 		 773 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  33.71 
 
 		 1594 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  52.9 
 
 		 1579 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  27.83 
 
 		 995 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  45.11 
 
 		 955 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  45.11 
 
 		 955 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.07 
 
 		 947 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.31 
 
 		 868 aa  87.4  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  67.65 
 
 		 1349 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  67.65 
 
 		 1327 aa  87  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  67.65 
 
 		 1327 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48.04 
 
 		 1023 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  25.64 
 
 		 1234 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  61.76 
 
 		 989 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.46 
 
 		 1086 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  57.33 
 
 		 3322 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  30.52 
 
 		 1763 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  29.48 
 
 		 1770 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  50.62 
 
 		 1165 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  53.01 
 
 		 1108 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  50.62 
 
 		 1165 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  30.31 
 
 		 1762 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  30.31 
 
 		 1762 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  42.11 
 
 		 1269 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.92 
 
 		 806 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  32.08 
 
 		 2926 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  29.45 
 
 		 1770 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  41.45 
 
 		 1259 aa  74.7  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  42.11 
 
 		 1268 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  42.11 
 
 		 1259 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  54.55 
 
 		 2057 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  42.11 
 
 		 1285 aa  73.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  43.07 
 
 		 1254 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  27.74 
 
 		 1753 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  36.24 
 
 		 3420 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  36.24 
 
 		 3415 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  53.52 
 
 		 466 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  40 
 
 		 1327 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  51.72 
 
 		 914 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  53.52 
 
 		 1626 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  53.52 
 
 		 1806 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  61.76 
 
 		 2637 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  51.43 
 
 		 1012 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  57.14 
 
 		 1593 aa  69.7  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  32.5 
 
 		 1571 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  31.38 
 
 		 1004 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  31.38 
 
 		 997 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  54.41 
 
 		 950 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  55.88 
 
 		 1113 aa  68.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  55.88 
 
 		 861 aa  68.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  26.21 
 
 		 1028 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.83 
 
 		 1055 aa  66.6  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  56.06 
 
 		 1068 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1310  hypothetical protein  43.75 
 
 		 69 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.150816  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  37.5 
 
 		 1748 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  46.38 
 
 		 4391 aa  64.3  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  46.38 
 
 		 4312 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  57.14 
 
 		 1357 aa  63.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  36.8 
 
 		 818 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  38.98 
 
 		 1049 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  48.05 
 
 		 924 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  47.37 
 
 		 1102 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  48.1 
 
 		 1099 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  28.21 
 
 		 1070 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  49.38 
 
 		 1741 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  29.05 
 
 		 1067 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  28.21 
 
 		 1070 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  47.37 
 
 		 825 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  58.57 
 
 		 1861 aa  58.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  58.57 
 
 		 2578 aa  58.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  58.57 
 
 		 2906 aa  57.4  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  49.37 
 
 		 1009 aa  54.7  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  35 
 
 		 1234 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  35 
 
 		 1250 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  43.94 
 
 		 864 aa  53.9  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35 
 
 		 1234 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  44.16 
 
 		 927 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  48.05 
 
 		 1040 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  44.74 
 
 		 819 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  34.29 
 
 		 1250 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  34.07 
 
 		 1254 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  32.64 
 
 		 1252 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  34.29 
 
 		 1234 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  46.25 
 
 		 1115 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.05 
 
 		 1122 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  44.29 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  44.29 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  46.05 
 
 		 1144 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  24.73 
 
 		 1886 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>