49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1283 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 870 aa  1726    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1220  outer membrane autotransporter barrel domain protein  56.82 
 
 		 863 aa  864    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0823  outer membrane autotransporter barrel domain protein  55.34 
 
 		 855 aa  830    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  72.99 
 
 		 854 aa  1181    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0204  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48.58 
 
 		 857 aa  708    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  22.86 
 
 		 1594 aa  99  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  22.07 
 
 		 1806 aa  85.1  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  22.58 
 
 		 1327 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  22.15 
 
 		 1349 aa  81.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  23.12 
 
 		 2637 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  22.63 
 
 		 466 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  21.79 
 
 		 1327 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  21.79 
 
 		 1327 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  23.77 
 
 		 1579 aa  77  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  25.12 
 
 		 955 aa  74.7  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  24.65 
 
 		 955 aa  71.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  23.04 
 
 		 4312 aa  70.1  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  23.04 
 
 		 4391 aa  69.3  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.04 
 
 		 868 aa  69.3  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  22.86 
 
 		 989 aa  68.2  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  23.29 
 
 		 773 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1165 aa  61.6  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1165 aa  61.6  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.62 
 
 		 1357 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  21.71 
 
 		 1102 aa  56.2  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  21.08 
 
 		 1144 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 		 818 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.49 
 
 		 1086 aa  52.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  24.14 
 
 		 1004 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  23.79 
 
 		 997 aa  51.6  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  25.89 
 
 		 306 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.2 
 
 		 3322 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  27.21 
 
 		 1099 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  21.93 
 
 		 1234 aa  48.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  23.21 
 
 		 947 aa  48.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.68 
 
 		 1197 aa  48.1  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.63 
 
 		 806 aa  47.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  24.32 
 
 		 825 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  24.54 
 
 		 1277 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  27.94 
 
 		 1108 aa  46.6  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  22.1 
 
 		 1748 aa  47  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  24.48 
 
 		 338 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  23.63 
 
 		 819 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.27 
 
 		 1122 aa  45.8  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  22.43 
 
 		 924 aa  45.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  30.34 
 
 		 927 aa  45.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  21.73 
 
 		 1234 aa  45.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  25.97 
 
 		 909 aa  45.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  30.77 
 
 		 1250 aa  44.3  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>