146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2225 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  100 
 
 		 773 aa  1543    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  54.05 
 
 		 732 aa  781    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  48.25 
 
 		 729 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  47.72 
 
 		 731 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  50 
 
 		 733 aa  689    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  48.9 
 
 		 747 aa  628  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  45.3 
 
 		 730 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  40.73 
 
 		 769 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  40 
 
 		 709 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  40.11 
 
 		 1008 aa  399  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  35.37 
 
 		 863 aa  258  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  35.37 
 
 		 863 aa  258  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  35.37 
 
 		 836 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.37 
 
 		 836 aa  257  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  35.37 
 
 		 836 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  35.68 
 
 		 863 aa  253  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  35.37 
 
 		 429 aa  253  9.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  33.52 
 
 		 759 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  33.52 
 
 		 759 aa  247  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  33.33 
 
 		 759 aa  243  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1571 aa  237  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1565 aa  237  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  33.41 
 
 		 638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  33.41 
 
 		 638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  31.84 
 
 		 1526 aa  234  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.84 
 
 		 1526 aa  234  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  33.18 
 
 		 638 aa  233  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  32.86 
 
 		 1541 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  33.42 
 
 		 1117 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  32.63 
 
 		 1441 aa  216  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  32.92 
 
 		 562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  28.99 
 
 		 815 aa  169  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  25.71 
 
 		 765 aa  160  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  30.32 
 
 		 1003 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  30.79 
 
 		 680 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  30.62 
 
 		 681 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  30.79 
 
 		 470 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  30.62 
 
 		 868 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  37.55 
 
 		 236 aa  153  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  26.97 
 
 		 800 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  27.91 
 
 		 714 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  28.13 
 
 		 1000 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  28.17 
 
 		 465 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 		 968 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  27.39 
 
 		 968 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  27.39 
 
 		 922 aa  132  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  27.91 
 
 		 398 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  27.55 
 
 		 955 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.55 
 
 		 955 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  27.55 
 
 		 955 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  27.55 
 
 		 955 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  27.71 
 
 		 961 aa  124  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  27.17 
 
 		 947 aa  119  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  26.52 
 
 		 1602 aa  114  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  24.96 
 
 		 1806 aa  101  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  25.78 
 
 		 1327 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.4 
 
 		 1067 aa  97.8  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.35 
 
 		 1770 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  26.15 
 
 		 1234 aa  95.9  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  26.99 
 
 		 1762 aa  96.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  26.99 
 
 		 1762 aa  96.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  27.32 
 
 		 4391 aa  95.9  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  25.86 
 
 		 1770 aa  94.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  27.6 
 
 		 4312 aa  94.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  26.38 
 
 		 1763 aa  94  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  26.49 
 
 		 1748 aa  93.6  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  27.55 
 
 		 466 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  25.42 
 
 		 1753 aa  91.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  26.09 
 
 		 1070 aa  92  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  25.93 
 
 		 1070 aa  92  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  23.98 
 
 		 1594 aa  91.3  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  25.23 
 
 		 1366 aa  89  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  27.18 
 
 		 955 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  27.18 
 
 		 955 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.89 
 
 		 806 aa  88.2  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  24.74 
 
 		 1277 aa  85.1  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  23.14 
 
 		 1579 aa  84.3  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  41.38 
 
 		 136 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  25.21 
 
 		 1349 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.78 
 
 		 868 aa  78.2  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  25.04 
 
 		 1327 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1327 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  24.2 
 
 		 1300 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  42.06 
 
 		 108 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  24.24 
 
 		 989 aa  74.3  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  44 
 
 		 108 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  24.44 
 
 		 1254 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  24.38 
 
 		 1040 aa  71.2  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  24.39 
 
 		 1250 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.61 
 
 		 1234 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  23.32 
 
 		 773 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  25.28 
 
 		 1234 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1165 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  23.64 
 
 		 2057 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1165 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  24.32 
 
 		 995 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  24.22 
 
 		 2637 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  23.95 
 
 		 1234 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  24.5 
 
 		 1252 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  24.56 
 
 		 1099 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>