59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0402 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  97.24 
 
 		 398 aa  744    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 714 aa  1412    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  70.01 
 
 		 1000 aa  938    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  89.65 
 
 		 470 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  93.72 
 
 		 968 aa  1295    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  71.69 
 
 		 868 aa  1005    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  67.49 
 
 		 1003 aa  926    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  93.72 
 
 		 968 aa  1295    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  85 
 
 		 680 aa  1143    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  93.44 
 
 		 922 aa  1293    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  93.01 
 
 		 465 aa  812    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  72.96 
 
 		 681 aa  954    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0434  hypothetical protein  55.04 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  33.68 
 
 		 765 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.07 
 
 		 729 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  28.05 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  27.91 
 
 		 773 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  26.98 
 
 		 769 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  26.53 
 
 		 732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  27.18 
 
 		 1008 aa  135  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  23.96 
 
 		 709 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  27.54 
 
 		 731 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  26.65 
 
 		 730 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  26.34 
 
 		 747 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  27.59 
 
 		 429 aa  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  27.59 
 
 		 863 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  26.91 
 
 		 836 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  26.91 
 
 		 836 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.91 
 
 		 836 aa  107  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  27.59 
 
 		 863 aa  107  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  28.86 
 
 		 1541 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  27.44 
 
 		 863 aa  104  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  28.52 
 
 		 1441 aa  101  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  28.62 
 
 		 562 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  27.15 
 
 		 815 aa  92  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  28.24 
 
 		 1117 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  23.02 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  23.02 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  23.16 
 
 		 638 aa  84.3  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  25.28 
 
 		 800 aa  84  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  23.88 
 
 		 759 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  23.88 
 
 		 759 aa  82  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  23.63 
 
 		 759 aa  80.9  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1571 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 		 1526 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1565 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.25 
 
 		 1526 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  26.05 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  27.66 
 
 		 763 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  30.77 
 
 		 2848 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  25.28 
 
 		 1300 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  25.63 
 
 		 759 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.06 
 
 		 979 aa  47.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4650  serine protease EatA  25.37 
 
 		 1285 aa  46.2  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.23 
 
 		 641 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  22.86 
 
 		 1806 aa  45.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  25.75 
 
 		 1099 aa  44.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  23.86 
 
 		 1327 aa  44.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  24.14 
 
 		 980 aa  44.3  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>